Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms