Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNMO15061 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNMO15061 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNMO15061 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNMO15061 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNMO15061 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
SYNMO15061 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SYNMO15061 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SYNMO15061 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SYNMO15061 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SYNMO15061 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SYNMO15061 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
SYNMO15061 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SYNMO15061 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SYNMO15061 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SYNMO15061 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
SYNMO15061 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SYNMO15061 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SYNMO15061 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNMO15061 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNMO15061 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNMO15061 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNMO15061 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNMO15061 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNMO15061 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNMO15061 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNMO15061 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNMO15061 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNMO15061 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNMO15061 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNMO15061 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNMO15061 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNMO15061 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNMO15061 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNMO15061 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNMO15061 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNMO15061 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNMO15061 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNMO15061 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SYNMO15061 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYNMO15061 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYNMO15061 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SYNMO15061 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SYNMO15061 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYNMO15061 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYNMO15061 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYNMO15061 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SYNMO15061 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SYNMO15061 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYNMO15061 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYNMO15061 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYNMO15061 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SYNMO15061 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SYNMO15061 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SYNMO15061 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYNMO15061 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNMO15061 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNMO15061 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNMO15061 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNMO15061 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNMO15061 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNMO15061 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNMO15061 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNMO15061 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNMO15061 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNMO15061 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNMO15061 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNMO15061 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNMO15061 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNMO15061 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNMO15061 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNMO15061 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNMO15061 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNMO15061 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNMO15061 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNMO15061 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNMO15061 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNMO15061 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNMO15061 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNMO15061 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNMO15061 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNMO15061 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNMO15061 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNMO15061 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNMO15061 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNMO15061 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNMO15061 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNMO15061 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNMO15061 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNMO15061 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNMO15061 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNMO15061 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNMO15061 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNMO15061 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNMO15061 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNMO15061 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNMO15061 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNMO15061 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNMO15061 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNMO15061 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms