Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLGNO14967 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLGNO14967 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLGNO14967 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLGNO14967 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLGNO14967 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLGNO14967 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLGNO14967 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLGNO14967 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLGNO14967 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLGNO14967 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLGNO14967 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLGNO14967 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLGNO14967 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLGNO14967 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLGNO14967 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLGNO14967 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CLGNO14967 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLGNO14967 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CLGNO14967 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLGNO14967 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLGNO14967 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLGNO14967 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLGNO14967 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLGNO14967 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLGNO14967 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLGNO14967 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLGNO14967 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLGNO14967 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLGNO14967 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLGNO14967 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLGNO14967 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLGNO14967 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLGNO14967 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLGNO14967 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLGNO14967 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLGNO14967 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLGNO14967 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLGNO14967 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CLGNO14967 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CLGNO14967 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CLGNO14967 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CLGNO14967 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLGNO14967 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLGNO14967 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLGNO14967 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLGNO14967 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLGNO14967 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLGNO14967 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CLGNO14967 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLGNO14967 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLGNO14967 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLGNO14967 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLGNO14967 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLGNO14967 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLGNO14967 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLGNO14967 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLGNO14967 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLGNO14967 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CLGNO14967 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLGNO14967 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLGNO14967 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLGNO14967 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLGNO14967 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLGNO14967 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLGNO14967 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLGNO14967 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLGNO14967 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLGNO14967 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLGNO14967 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLGNO14967 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLGNO14967 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLGNO14967 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLGNO14967 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLGNO14967 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLGNO14967 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLGNO14967 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CLGNO14967 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CLGNO14967 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLGNO14967 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLGNO14967 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLGNO14967 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLGNO14967 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLGNO14967 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLGNO14967 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLGNO14967 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLGNO14967 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLGNO14967 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLGNO14967 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLGNO14967 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLGNO14967 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLGNO14967 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLGNO14967 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLGNO14967 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLGNO14967 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLGNO14967 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLGNO14967 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLGNO14967 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLGNO14967 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLGNO14967 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms