Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms