Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms