Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMIM1B2RUZ4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms