Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms