Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYCE3A1L190 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SYCE3A1L190 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYCE3A1L190 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYCE3A1L190 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYCE3A1L190 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYCE3A1L190 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCE3A1L190 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCE3A1L190 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCE3A1L190 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCE3A1L190 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCE3A1L190 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCE3A1L190 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCE3A1L190 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCE3A1L190 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCE3A1L190 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCE3A1L190 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCE3A1L190 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCE3A1L190 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCE3A1L190 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCE3A1L190 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCE3A1L190 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCE3A1L190 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCE3A1L190 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCE3A1L190 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SYCE3A1L190 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCE3A1L190 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCE3A1L190 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCE3A1L190 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYCE3A1L190 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms