Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms