Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CAMTA1Q9Y6Y1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CAMTA1Q9Y6Y1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
CAMTA1Q9Y6Y1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CAMTA1Q9Y6Y1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CAMTA1Q9Y6Y1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CAMTA1Q9Y6Y1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CAMTA1Q9Y6Y1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CAMTA1Q9Y6Y1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CAMTA1Q9Y6Y1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CAMTA1Q9Y6Y1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CAMTA1Q9Y6Y1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CAMTA1Q9Y6Y1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
CAMTA1Q9Y6Y1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CAMTA1Q9Y6Y1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CAMTA1Q9Y6Y1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CAMTA1Q9Y6Y1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CAMTA1Q9Y6Y1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CAMTA1Q9Y6Y1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CAMTA1Q9Y6Y1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CAMTA1Q9Y6Y1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CAMTA1Q9Y6Y1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CAMTA1Q9Y6Y1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
CAMTA1Q9Y6Y1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CAMTA1Q9Y6Y1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CAMTA1Q9Y6Y1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CAMTA1Q9Y6Y1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CAMTA1Q9Y6Y1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CAMTA1Q9Y6Y1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CAMTA1Q9Y6Y1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CAMTA1Q9Y6Y1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
CAMTA1Q9Y6Y1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CAMTA1Q9Y6Y1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CAMTA1Q9Y6Y1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CAMTA1Q9Y6Y1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CAMTA1Q9Y6Y1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CAMTA1Q9Y6Y1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CAMTA1Q9Y6Y1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CAMTA1Q9Y6Y1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CAMTA1Q9Y6Y1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CAMTA1Q9Y6Y1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CAMTA1Q9Y6Y1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CAMTA1Q9Y6Y1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CAMTA1Q9Y6Y1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CAMTA1Q9Y6Y1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CAMTA1Q9Y6Y1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
CAMTA1Q9Y6Y1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CAMTA1Q9Y6Y1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CAMTA1Q9Y6Y1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CAMTA1Q9Y6Y1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CAMTA1Q9Y6Y1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CAMTA1Q9Y6Y1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CAMTA1Q9Y6Y1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CAMTA1Q9Y6Y1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CAMTA1Q9Y6Y1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CAMTA1Q9Y6Y1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CAMTA1Q9Y6Y1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CAMTA1Q9Y6Y1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CAMTA1Q9Y6Y1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CAMTA1Q9Y6Y1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CAMTA1Q9Y6Y1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CAMTA1Q9Y6Y1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CAMTA1Q9Y6Y1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CAMTA1Q9Y6Y1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CAMTA1Q9Y6Y1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CAMTA1Q9Y6Y1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CAMTA1Q9Y6Y1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CAMTA1Q9Y6Y1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CAMTA1Q9Y6Y1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CAMTA1Q9Y6Y1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CAMTA1Q9Y6Y1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CAMTA1Q9Y6Y1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CAMTA1Q9Y6Y1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CAMTA1Q9Y6Y1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CAMTA1Q9Y6Y1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CAMTA1Q9Y6Y1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CAMTA1Q9Y6Y1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
CAMTA1Q9Y6Y1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
CAMTA1Q9Y6Y1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CAMTA1Q9Y6Y1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CAMTA1Q9Y6Y1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CAMTA1Q9Y6Y1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CAMTA1Q9Y6Y1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CAMTA1Q9Y6Y1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
CAMTA1Q9Y6Y1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CAMTA1Q9Y6Y1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
CAMTA1Q9Y6Y1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CAMTA1Q9Y6Y1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CAMTA1Q9Y6Y1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CAMTA1Q9Y6Y1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms