Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP15Q9Y4E8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP15Q9Y4E8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP15Q9Y4E8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
USP15Q9Y4E8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP15Q9Y4E8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP15Q9Y4E8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USP15Q9Y4E8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP15Q9Y4E8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USP15Q9Y4E8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
USP15Q9Y4E8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USP15Q9Y4E8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP15Q9Y4E8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP15Q9Y4E8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
USP15Q9Y4E8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP15Q9Y4E8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP15Q9Y4E8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP15Q9Y4E8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP15Q9Y4E8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP15Q9Y4E8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP15Q9Y4E8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP15Q9Y4E8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP15Q9Y4E8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP15Q9Y4E8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
USP15Q9Y4E8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP15Q9Y4E8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
USP15Q9Y4E8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
USP15Q9Y4E8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP15Q9Y4E8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
USP15Q9Y4E8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP15Q9Y4E8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP15Q9Y4E8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP15Q9Y4E8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP15Q9Y4E8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP15Q9Y4E8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP15Q9Y4E8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP15Q9Y4E8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
USP15Q9Y4E8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP15Q9Y4E8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP15Q9Y4E8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP15Q9Y4E8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP15Q9Y4E8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP15Q9Y4E8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP15Q9Y4E8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP15Q9Y4E8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP15Q9Y4E8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
USP15Q9Y4E8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP15Q9Y4E8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP15Q9Y4E8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP15Q9Y4E8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
USP15Q9Y4E8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP15Q9Y4E8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP15Q9Y4E8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP15Q9Y4E8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP15Q9Y4E8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP15Q9Y4E8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP15Q9Y4E8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP15Q9Y4E8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP15Q9Y4E8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP15Q9Y4E8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP15Q9Y4E8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP15Q9Y4E8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP15Q9Y4E8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP15Q9Y4E8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP15Q9Y4E8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP15Q9Y4E8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP15Q9Y4E8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP15Q9Y4E8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP15Q9Y4E8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP15Q9Y4E8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP15Q9Y4E8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP15Q9Y4E8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP15Q9Y4E8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP15Q9Y4E8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP15Q9Y4E8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP15Q9Y4E8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP15Q9Y4E8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP15Q9Y4E8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP15Q9Y4E8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP15Q9Y4E8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP15Q9Y4E8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP15Q9Y4E8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP15Q9Y4E8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP15Q9Y4E8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP15Q9Y4E8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP15Q9Y4E8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
USP15Q9Y4E8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP15Q9Y4E8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP15Q9Y4E8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP15Q9Y4E8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP15Q9Y4E8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
USP15Q9Y4E8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP15Q9Y4E8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP15Q9Y4E8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP15Q9Y4E8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP15Q9Y4E8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP15Q9Y4E8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP15Q9Y4E8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP15Q9Y4E8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP15Q9Y4E8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms