Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2R2

PTPN22, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 22, humanhuman

Predictions only

Length 807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN22Q9Y2R2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPN22Q9Y2R2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPN22Q9Y2R2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPN22Q9Y2R2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPN22Q9Y2R2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPN22Q9Y2R2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPN22Q9Y2R2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPN22Q9Y2R2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPN22Q9Y2R2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPN22Q9Y2R2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPN22Q9Y2R2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPN22Q9Y2R2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPN22Q9Y2R2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPN22Q9Y2R2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPN22Q9Y2R2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPN22Q9Y2R2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPN22Q9Y2R2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPN22Q9Y2R2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPN22Q9Y2R2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPN22Q9Y2R2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPN22Q9Y2R2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPN22Q9Y2R2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPN22Q9Y2R2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPN22Q9Y2R2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPN22Q9Y2R2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPN22Q9Y2R2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPN22Q9Y2R2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPN22Q9Y2R2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPN22Q9Y2R2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPN22Q9Y2R2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPN22Q9Y2R2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPN22Q9Y2R2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPN22Q9Y2R2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPN22Q9Y2R2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPN22Q9Y2R2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPN22Q9Y2R2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPN22Q9Y2R2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPN22Q9Y2R2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPN22Q9Y2R2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPN22Q9Y2R2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPN22Q9Y2R2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPN22Q9Y2R2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPN22Q9Y2R2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPN22Q9Y2R2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPN22Q9Y2R2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPN22Q9Y2R2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPN22Q9Y2R2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPN22Q9Y2R2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPN22Q9Y2R2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPN22Q9Y2R2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPN22Q9Y2R2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPN22Q9Y2R2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPN22Q9Y2R2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPN22Q9Y2R2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPN22Q9Y2R2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPN22Q9Y2R2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPN22Q9Y2R2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPN22Q9Y2R2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPN22Q9Y2R2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPN22Q9Y2R2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPN22Q9Y2R2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPN22Q9Y2R2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPN22Q9Y2R2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPN22Q9Y2R2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPN22Q9Y2R2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPN22Q9Y2R2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPN22Q9Y2R2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPN22Q9Y2R2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPN22Q9Y2R2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPN22Q9Y2R2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPN22Q9Y2R2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPN22Q9Y2R2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPN22Q9Y2R2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPN22Q9Y2R2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPN22Q9Y2R2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPN22Q9Y2R2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPN22Q9Y2R2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPN22Q9Y2R2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPN22Q9Y2R2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPN22Q9Y2R2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PTPN22Q9Y2R2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPN22Q9Y2R2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPN22Q9Y2R2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPN22Q9Y2R2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPN22Q9Y2R2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PTPN22Q9Y2R2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPN22Q9Y2R2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPN22Q9Y2R2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPN22Q9Y2R2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPN22Q9Y2R2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPN22Q9Y2R2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPN22Q9Y2R2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPN22Q9Y2R2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPN22Q9Y2R2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPN22Q9Y2R2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPN22Q9Y2R2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPN22Q9Y2R2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPN22Q9Y2R2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPN22Q9Y2R2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPN22Q9Y2R2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms