Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EFR3BQ9Y2G0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EFR3BQ9Y2G0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EFR3BQ9Y2G0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EFR3BQ9Y2G0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EFR3BQ9Y2G0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EFR3BQ9Y2G0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EFR3BQ9Y2G0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EFR3BQ9Y2G0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EFR3BQ9Y2G0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EFR3BQ9Y2G0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EFR3BQ9Y2G0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EFR3BQ9Y2G0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EFR3BQ9Y2G0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EFR3BQ9Y2G0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EFR3BQ9Y2G0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EFR3BQ9Y2G0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EFR3BQ9Y2G0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EFR3BQ9Y2G0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
EFR3BQ9Y2G0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26■■□□□ 1.75
EFR3BQ9Y2G0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EFR3BQ9Y2G0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
EFR3BQ9Y2G0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EFR3BQ9Y2G0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EFR3BQ9Y2G0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
EFR3BQ9Y2G0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EFR3BQ9Y2G0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EFR3BQ9Y2G0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EFR3BQ9Y2G0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EFR3BQ9Y2G0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EFR3BQ9Y2G0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EFR3BQ9Y2G0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EFR3BQ9Y2G0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EFR3BQ9Y2G0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EFR3BQ9Y2G0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EFR3BQ9Y2G0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EFR3BQ9Y2G0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EFR3BQ9Y2G0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EFR3BQ9Y2G0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EFR3BQ9Y2G0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EFR3BQ9Y2G0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EFR3BQ9Y2G0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EFR3BQ9Y2G0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EFR3BQ9Y2G0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EFR3BQ9Y2G0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EFR3BQ9Y2G0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EFR3BQ9Y2G0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EFR3BQ9Y2G0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EFR3BQ9Y2G0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EFR3BQ9Y2G0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EFR3BQ9Y2G0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EFR3BQ9Y2G0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EFR3BQ9Y2G0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EFR3BQ9Y2G0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EFR3BQ9Y2G0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EFR3BQ9Y2G0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EFR3BQ9Y2G0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EFR3BQ9Y2G0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EFR3BQ9Y2G0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EFR3BQ9Y2G0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EFR3BQ9Y2G0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EFR3BQ9Y2G0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EFR3BQ9Y2G0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EFR3BQ9Y2G0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EFR3BQ9Y2G0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EFR3BQ9Y2G0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EFR3BQ9Y2G0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EFR3BQ9Y2G0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EFR3BQ9Y2G0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EFR3BQ9Y2G0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EFR3BQ9Y2G0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EFR3BQ9Y2G0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EFR3BQ9Y2G0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EFR3BQ9Y2G0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EFR3BQ9Y2G0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EFR3BQ9Y2G0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EFR3BQ9Y2G0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EFR3BQ9Y2G0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EFR3BQ9Y2G0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EFR3BQ9Y2G0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
EFR3BQ9Y2G0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EFR3BQ9Y2G0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EFR3BQ9Y2G0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EFR3BQ9Y2G0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EFR3BQ9Y2G0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EFR3BQ9Y2G0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EFR3BQ9Y2G0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EFR3BQ9Y2G0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EFR3BQ9Y2G0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EFR3BQ9Y2G0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EFR3BQ9Y2G0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EFR3BQ9Y2G0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EFR3BQ9Y2G0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EFR3BQ9Y2G0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EFR3BQ9Y2G0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EFR3BQ9Y2G0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EFR3BQ9Y2G0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EFR3BQ9Y2G0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EFR3BQ9Y2G0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EFR3BQ9Y2G0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms