Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBEC2Q9Y235 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBEC2Q9Y235 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBEC2Q9Y235 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC2Q9Y235 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC2Q9Y235 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC2Q9Y235 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC2Q9Y235 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC2Q9Y235 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC2Q9Y235 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC2Q9Y235 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC2Q9Y235 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC2Q9Y235 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC2Q9Y235 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC2Q9Y235 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC2Q9Y235 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms