Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHOC2Q9UQ13 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHOC2Q9UQ13 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHOC2Q9UQ13 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SHOC2Q9UQ13 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SHOC2Q9UQ13 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SHOC2Q9UQ13 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHOC2Q9UQ13 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHOC2Q9UQ13 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SHOC2Q9UQ13 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHOC2Q9UQ13 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHOC2Q9UQ13 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHOC2Q9UQ13 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHOC2Q9UQ13 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHOC2Q9UQ13 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHOC2Q9UQ13 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SHOC2Q9UQ13 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHOC2Q9UQ13 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHOC2Q9UQ13 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHOC2Q9UQ13 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHOC2Q9UQ13 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHOC2Q9UQ13 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHOC2Q9UQ13 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHOC2Q9UQ13 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHOC2Q9UQ13 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHOC2Q9UQ13 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHOC2Q9UQ13 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHOC2Q9UQ13 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHOC2Q9UQ13 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHOC2Q9UQ13 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHOC2Q9UQ13 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SHOC2Q9UQ13 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHOC2Q9UQ13 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SHOC2Q9UQ13 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHOC2Q9UQ13 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHOC2Q9UQ13 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHOC2Q9UQ13 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHOC2Q9UQ13 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHOC2Q9UQ13 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHOC2Q9UQ13 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHOC2Q9UQ13 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHOC2Q9UQ13 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHOC2Q9UQ13 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHOC2Q9UQ13 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHOC2Q9UQ13 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHOC2Q9UQ13 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHOC2Q9UQ13 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SHOC2Q9UQ13 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHOC2Q9UQ13 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHOC2Q9UQ13 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHOC2Q9UQ13 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHOC2Q9UQ13 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHOC2Q9UQ13 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHOC2Q9UQ13 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHOC2Q9UQ13 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHOC2Q9UQ13 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SHOC2Q9UQ13 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHOC2Q9UQ13 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHOC2Q9UQ13 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SHOC2Q9UQ13 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHOC2Q9UQ13 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHOC2Q9UQ13 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHOC2Q9UQ13 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHOC2Q9UQ13 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHOC2Q9UQ13 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHOC2Q9UQ13 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHOC2Q9UQ13 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHOC2Q9UQ13 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHOC2Q9UQ13 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHOC2Q9UQ13 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHOC2Q9UQ13 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHOC2Q9UQ13 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHOC2Q9UQ13 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHOC2Q9UQ13 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHOC2Q9UQ13 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHOC2Q9UQ13 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHOC2Q9UQ13 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHOC2Q9UQ13 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHOC2Q9UQ13 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHOC2Q9UQ13 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHOC2Q9UQ13 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHOC2Q9UQ13 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHOC2Q9UQ13 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHOC2Q9UQ13 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHOC2Q9UQ13 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHOC2Q9UQ13 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHOC2Q9UQ13 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHOC2Q9UQ13 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHOC2Q9UQ13 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHOC2Q9UQ13 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHOC2Q9UQ13 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SHOC2Q9UQ13 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHOC2Q9UQ13 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHOC2Q9UQ13 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHOC2Q9UQ13 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHOC2Q9UQ13 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHOC2Q9UQ13 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHOC2Q9UQ13 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHOC2Q9UQ13 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHOC2Q9UQ13 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
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