Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PADI1Q9ULC6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PADI1Q9ULC6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PADI1Q9ULC6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PADI1Q9ULC6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PADI1Q9ULC6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PADI1Q9ULC6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PADI1Q9ULC6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PADI1Q9ULC6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PADI1Q9ULC6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PADI1Q9ULC6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PADI1Q9ULC6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PADI1Q9ULC6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PADI1Q9ULC6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PADI1Q9ULC6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PADI1Q9ULC6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PADI1Q9ULC6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PADI1Q9ULC6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PADI1Q9ULC6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PADI1Q9ULC6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PADI1Q9ULC6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PADI1Q9ULC6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PADI1Q9ULC6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PADI1Q9ULC6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PADI1Q9ULC6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PADI1Q9ULC6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PADI1Q9ULC6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PADI1Q9ULC6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PADI1Q9ULC6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PADI1Q9ULC6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PADI1Q9ULC6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PADI1Q9ULC6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PADI1Q9ULC6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PADI1Q9ULC6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PADI1Q9ULC6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PADI1Q9ULC6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PADI1Q9ULC6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PADI1Q9ULC6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PADI1Q9ULC6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PADI1Q9ULC6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PADI1Q9ULC6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PADI1Q9ULC6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PADI1Q9ULC6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PADI1Q9ULC6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PADI1Q9ULC6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PADI1Q9ULC6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PADI1Q9ULC6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PADI1Q9ULC6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PADI1Q9ULC6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PADI1Q9ULC6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PADI1Q9ULC6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PADI1Q9ULC6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PADI1Q9ULC6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PADI1Q9ULC6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PADI1Q9ULC6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PADI1Q9ULC6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PADI1Q9ULC6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PADI1Q9ULC6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PADI1Q9ULC6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PADI1Q9ULC6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PADI1Q9ULC6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PADI1Q9ULC6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PADI1Q9ULC6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PADI1Q9ULC6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PADI1Q9ULC6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PADI1Q9ULC6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PADI1Q9ULC6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PADI1Q9ULC6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PADI1Q9ULC6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PADI1Q9ULC6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PADI1Q9ULC6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PADI1Q9ULC6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PADI1Q9ULC6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PADI1Q9ULC6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PADI1Q9ULC6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PADI1Q9ULC6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PADI1Q9ULC6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PADI1Q9ULC6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PADI1Q9ULC6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PADI1Q9ULC6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PADI1Q9ULC6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PADI1Q9ULC6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PADI1Q9ULC6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PADI1Q9ULC6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PADI1Q9ULC6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PADI1Q9ULC6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PADI1Q9ULC6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PADI1Q9ULC6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PADI1Q9ULC6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PADI1Q9ULC6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PADI1Q9ULC6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PADI1Q9ULC6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PADI1Q9ULC6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PADI1Q9ULC6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PADI1Q9ULC6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PADI1Q9ULC6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PADI1Q9ULC6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PADI1Q9ULC6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PADI1Q9ULC6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PADI1Q9ULC6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms