Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRTO4Q9UKD2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRTO4Q9UKD2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRTO4Q9UKD2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRTO4Q9UKD2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRTO4Q9UKD2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRTO4Q9UKD2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRTO4Q9UKD2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRTO4Q9UKD2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MRTO4Q9UKD2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRTO4Q9UKD2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRTO4Q9UKD2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRTO4Q9UKD2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRTO4Q9UKD2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MRTO4Q9UKD2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRTO4Q9UKD2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRTO4Q9UKD2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRTO4Q9UKD2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRTO4Q9UKD2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRTO4Q9UKD2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRTO4Q9UKD2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRTO4Q9UKD2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRTO4Q9UKD2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRTO4Q9UKD2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRTO4Q9UKD2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRTO4Q9UKD2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRTO4Q9UKD2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MRTO4Q9UKD2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRTO4Q9UKD2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRTO4Q9UKD2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MRTO4Q9UKD2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MRTO4Q9UKD2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRTO4Q9UKD2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRTO4Q9UKD2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRTO4Q9UKD2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MRTO4Q9UKD2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRTO4Q9UKD2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRTO4Q9UKD2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRTO4Q9UKD2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MRTO4Q9UKD2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRTO4Q9UKD2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRTO4Q9UKD2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRTO4Q9UKD2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRTO4Q9UKD2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRTO4Q9UKD2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRTO4Q9UKD2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRTO4Q9UKD2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRTO4Q9UKD2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRTO4Q9UKD2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRTO4Q9UKD2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRTO4Q9UKD2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRTO4Q9UKD2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRTO4Q9UKD2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRTO4Q9UKD2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRTO4Q9UKD2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRTO4Q9UKD2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRTO4Q9UKD2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRTO4Q9UKD2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRTO4Q9UKD2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRTO4Q9UKD2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MRTO4Q9UKD2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRTO4Q9UKD2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRTO4Q9UKD2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRTO4Q9UKD2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRTO4Q9UKD2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRTO4Q9UKD2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRTO4Q9UKD2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRTO4Q9UKD2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRTO4Q9UKD2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRTO4Q9UKD2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRTO4Q9UKD2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRTO4Q9UKD2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRTO4Q9UKD2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRTO4Q9UKD2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRTO4Q9UKD2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRTO4Q9UKD2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MRTO4Q9UKD2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MRTO4Q9UKD2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRTO4Q9UKD2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRTO4Q9UKD2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRTO4Q9UKD2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRTO4Q9UKD2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRTO4Q9UKD2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRTO4Q9UKD2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRTO4Q9UKD2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRTO4Q9UKD2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRTO4Q9UKD2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRTO4Q9UKD2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRTO4Q9UKD2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRTO4Q9UKD2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRTO4Q9UKD2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRTO4Q9UKD2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRTO4Q9UKD2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRTO4Q9UKD2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRTO4Q9UKD2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRTO4Q9UKD2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRTO4Q9UKD2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRTO4Q9UKD2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRTO4Q9UKD2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRTO4Q9UKD2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms