Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SCN11AQ9UI33 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SCN11AQ9UI33 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SCN11AQ9UI33 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SCN11AQ9UI33 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SCN11AQ9UI33 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SCN11AQ9UI33 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SCN11AQ9UI33 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SCN11AQ9UI33 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SCN11AQ9UI33 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SCN11AQ9UI33 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SCN11AQ9UI33 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
SCN11AQ9UI33 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SCN11AQ9UI33 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SCN11AQ9UI33 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33■■■□□ 2.87
SCN11AQ9UI33 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SCN11AQ9UI33 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SCN11AQ9UI33 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SCN11AQ9UI33 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SCN11AQ9UI33 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SCN11AQ9UI33 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SCN11AQ9UI33 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SCN11AQ9UI33 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SCN11AQ9UI33 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
SCN11AQ9UI33 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SCN11AQ9UI33 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SCN11AQ9UI33 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SCN11AQ9UI33 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SCN11AQ9UI33 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SCN11AQ9UI33 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SCN11AQ9UI33 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SCN11AQ9UI33 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
SCN11AQ9UI33 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SCN11AQ9UI33 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SCN11AQ9UI33 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SCN11AQ9UI33 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SCN11AQ9UI33 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SCN11AQ9UI33 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SCN11AQ9UI33 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SCN11AQ9UI33 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
SCN11AQ9UI33 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SCN11AQ9UI33 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SCN11AQ9UI33 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SCN11AQ9UI33 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SCN11AQ9UI33 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SCN11AQ9UI33 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SCN11AQ9UI33 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SCN11AQ9UI33 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
SCN11AQ9UI33 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SCN11AQ9UI33 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SCN11AQ9UI33 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SCN11AQ9UI33 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SCN11AQ9UI33 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SCN11AQ9UI33 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
SCN11AQ9UI33 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SCN11AQ9UI33 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SCN11AQ9UI33 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SCN11AQ9UI33 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SCN11AQ9UI33 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
SCN11AQ9UI33 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SCN11AQ9UI33 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SCN11AQ9UI33 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SCN11AQ9UI33 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
SCN11AQ9UI33 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
SCN11AQ9UI33 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SCN11AQ9UI33 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
SCN11AQ9UI33 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SCN11AQ9UI33 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SCN11AQ9UI33 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SCN11AQ9UI33 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SCN11AQ9UI33 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SCN11AQ9UI33 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SCN11AQ9UI33 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SCN11AQ9UI33 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SCN11AQ9UI33 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SCN11AQ9UI33 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SCN11AQ9UI33 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SCN11AQ9UI33 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
SCN11AQ9UI33 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SCN11AQ9UI33 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SCN11AQ9UI33 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SCN11AQ9UI33 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SCN11AQ9UI33 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SCN11AQ9UI33 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
SCN11AQ9UI33 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SCN11AQ9UI33 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SCN11AQ9UI33 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SCN11AQ9UI33 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SCN11AQ9UI33 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SCN11AQ9UI33 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SCN11AQ9UI33 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SCN11AQ9UI33 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SCN11AQ9UI33 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SCN11AQ9UI33 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SCN11AQ9UI33 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SCN11AQ9UI33 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SCN11AQ9UI33 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SCN11AQ9UI33 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SCN11AQ9UI33 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SCN11AQ9UI33 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms