Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGJ1

TUBGCP4, Gamma-tubulin complex component 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP4Q9UGJ1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TUBGCP4Q9UGJ1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TUBGCP4Q9UGJ1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TUBGCP4Q9UGJ1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TUBGCP4Q9UGJ1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TUBGCP4Q9UGJ1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TUBGCP4Q9UGJ1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TUBGCP4Q9UGJ1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TUBGCP4Q9UGJ1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TUBGCP4Q9UGJ1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TUBGCP4Q9UGJ1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TUBGCP4Q9UGJ1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TUBGCP4Q9UGJ1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TUBGCP4Q9UGJ1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TUBGCP4Q9UGJ1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBGCP4Q9UGJ1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBGCP4Q9UGJ1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBGCP4Q9UGJ1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBGCP4Q9UGJ1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBGCP4Q9UGJ1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBGCP4Q9UGJ1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUBGCP4Q9UGJ1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUBGCP4Q9UGJ1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUBGCP4Q9UGJ1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUBGCP4Q9UGJ1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUBGCP4Q9UGJ1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUBGCP4Q9UGJ1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUBGCP4Q9UGJ1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TUBGCP4Q9UGJ1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUBGCP4Q9UGJ1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUBGCP4Q9UGJ1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUBGCP4Q9UGJ1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TUBGCP4Q9UGJ1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TUBGCP4Q9UGJ1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TUBGCP4Q9UGJ1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TUBGCP4Q9UGJ1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TUBGCP4Q9UGJ1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUBGCP4Q9UGJ1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUBGCP4Q9UGJ1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TUBGCP4Q9UGJ1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TUBGCP4Q9UGJ1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TUBGCP4Q9UGJ1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUBGCP4Q9UGJ1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUBGCP4Q9UGJ1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUBGCP4Q9UGJ1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUBGCP4Q9UGJ1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUBGCP4Q9UGJ1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUBGCP4Q9UGJ1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUBGCP4Q9UGJ1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TUBGCP4Q9UGJ1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUBGCP4Q9UGJ1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUBGCP4Q9UGJ1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUBGCP4Q9UGJ1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUBGCP4Q9UGJ1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUBGCP4Q9UGJ1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUBGCP4Q9UGJ1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUBGCP4Q9UGJ1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TUBGCP4Q9UGJ1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBGCP4Q9UGJ1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBGCP4Q9UGJ1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBGCP4Q9UGJ1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBGCP4Q9UGJ1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBGCP4Q9UGJ1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBGCP4Q9UGJ1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBGCP4Q9UGJ1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBGCP4Q9UGJ1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBGCP4Q9UGJ1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBGCP4Q9UGJ1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBGCP4Q9UGJ1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBGCP4Q9UGJ1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBGCP4Q9UGJ1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBGCP4Q9UGJ1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBGCP4Q9UGJ1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBGCP4Q9UGJ1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBGCP4Q9UGJ1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBGCP4Q9UGJ1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBGCP4Q9UGJ1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUBGCP4Q9UGJ1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUBGCP4Q9UGJ1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUBGCP4Q9UGJ1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUBGCP4Q9UGJ1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUBGCP4Q9UGJ1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBGCP4Q9UGJ1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBGCP4Q9UGJ1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBGCP4Q9UGJ1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBGCP4Q9UGJ1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBGCP4Q9UGJ1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBGCP4Q9UGJ1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBGCP4Q9UGJ1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBGCP4Q9UGJ1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBGCP4Q9UGJ1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBGCP4Q9UGJ1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBGCP4Q9UGJ1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBGCP4Q9UGJ1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBGCP4Q9UGJ1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBGCP4Q9UGJ1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms