Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms