Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCKIPSDQ9NZQ3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCKIPSDQ9NZQ3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCKIPSDQ9NZQ3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCKIPSDQ9NZQ3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NCKIPSDQ9NZQ3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCKIPSDQ9NZQ3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCKIPSDQ9NZQ3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCKIPSDQ9NZQ3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCKIPSDQ9NZQ3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCKIPSDQ9NZQ3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCKIPSDQ9NZQ3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCKIPSDQ9NZQ3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCKIPSDQ9NZQ3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCKIPSDQ9NZQ3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCKIPSDQ9NZQ3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCKIPSDQ9NZQ3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCKIPSDQ9NZQ3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCKIPSDQ9NZQ3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCKIPSDQ9NZQ3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCKIPSDQ9NZQ3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCKIPSDQ9NZQ3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCKIPSDQ9NZQ3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCKIPSDQ9NZQ3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCKIPSDQ9NZQ3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCKIPSDQ9NZQ3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCKIPSDQ9NZQ3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCKIPSDQ9NZQ3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCKIPSDQ9NZQ3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCKIPSDQ9NZQ3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCKIPSDQ9NZQ3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCKIPSDQ9NZQ3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCKIPSDQ9NZQ3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCKIPSDQ9NZQ3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCKIPSDQ9NZQ3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCKIPSDQ9NZQ3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCKIPSDQ9NZQ3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCKIPSDQ9NZQ3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCKIPSDQ9NZQ3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCKIPSDQ9NZQ3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCKIPSDQ9NZQ3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCKIPSDQ9NZQ3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCKIPSDQ9NZQ3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCKIPSDQ9NZQ3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCKIPSDQ9NZQ3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCKIPSDQ9NZQ3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCKIPSDQ9NZQ3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCKIPSDQ9NZQ3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCKIPSDQ9NZQ3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCKIPSDQ9NZQ3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCKIPSDQ9NZQ3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCKIPSDQ9NZQ3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCKIPSDQ9NZQ3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCKIPSDQ9NZQ3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCKIPSDQ9NZQ3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCKIPSDQ9NZQ3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NCKIPSDQ9NZQ3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCKIPSDQ9NZQ3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCKIPSDQ9NZQ3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCKIPSDQ9NZQ3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCKIPSDQ9NZQ3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCKIPSDQ9NZQ3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCKIPSDQ9NZQ3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCKIPSDQ9NZQ3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCKIPSDQ9NZQ3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCKIPSDQ9NZQ3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCKIPSDQ9NZQ3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NCKIPSDQ9NZQ3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCKIPSDQ9NZQ3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCKIPSDQ9NZQ3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCKIPSDQ9NZQ3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCKIPSDQ9NZQ3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCKIPSDQ9NZQ3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCKIPSDQ9NZQ3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCKIPSDQ9NZQ3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCKIPSDQ9NZQ3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCKIPSDQ9NZQ3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCKIPSDQ9NZQ3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCKIPSDQ9NZQ3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCKIPSDQ9NZQ3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NCKIPSDQ9NZQ3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCKIPSDQ9NZQ3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCKIPSDQ9NZQ3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCKIPSDQ9NZQ3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCKIPSDQ9NZQ3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCKIPSDQ9NZQ3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCKIPSDQ9NZQ3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCKIPSDQ9NZQ3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NCKIPSDQ9NZQ3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms