Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ94

NLGN3, Neuroligin-3, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN3Q9NZ94 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLGN3Q9NZ94 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLGN3Q9NZ94 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NLGN3Q9NZ94 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLGN3Q9NZ94 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NLGN3Q9NZ94 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLGN3Q9NZ94 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLGN3Q9NZ94 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLGN3Q9NZ94 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLGN3Q9NZ94 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLGN3Q9NZ94 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLGN3Q9NZ94 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLGN3Q9NZ94 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
NLGN3Q9NZ94 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NLGN3Q9NZ94 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLGN3Q9NZ94 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLGN3Q9NZ94 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLGN3Q9NZ94 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NLGN3Q9NZ94 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLGN3Q9NZ94 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLGN3Q9NZ94 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLGN3Q9NZ94 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLGN3Q9NZ94 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLGN3Q9NZ94 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLGN3Q9NZ94 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLGN3Q9NZ94 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLGN3Q9NZ94 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLGN3Q9NZ94 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLGN3Q9NZ94 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLGN3Q9NZ94 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NLGN3Q9NZ94 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLGN3Q9NZ94 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLGN3Q9NZ94 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLGN3Q9NZ94 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLGN3Q9NZ94 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLGN3Q9NZ94 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLGN3Q9NZ94 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLGN3Q9NZ94 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NLGN3Q9NZ94 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NLGN3Q9NZ94 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLGN3Q9NZ94 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLGN3Q9NZ94 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLGN3Q9NZ94 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLGN3Q9NZ94 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLGN3Q9NZ94 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLGN3Q9NZ94 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NLGN3Q9NZ94 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLGN3Q9NZ94 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLGN3Q9NZ94 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLGN3Q9NZ94 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLGN3Q9NZ94 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLGN3Q9NZ94 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLGN3Q9NZ94 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NLGN3Q9NZ94 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLGN3Q9NZ94 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLGN3Q9NZ94 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NLGN3Q9NZ94 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLGN3Q9NZ94 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLGN3Q9NZ94 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLGN3Q9NZ94 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NLGN3Q9NZ94 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NLGN3Q9NZ94 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NLGN3Q9NZ94 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLGN3Q9NZ94 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLGN3Q9NZ94 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLGN3Q9NZ94 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLGN3Q9NZ94 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLGN3Q9NZ94 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NLGN3Q9NZ94 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLGN3Q9NZ94 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLGN3Q9NZ94 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLGN3Q9NZ94 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLGN3Q9NZ94 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLGN3Q9NZ94 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLGN3Q9NZ94 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLGN3Q9NZ94 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLGN3Q9NZ94 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLGN3Q9NZ94 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLGN3Q9NZ94 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLGN3Q9NZ94 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NLGN3Q9NZ94 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NLGN3Q9NZ94 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLGN3Q9NZ94 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLGN3Q9NZ94 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLGN3Q9NZ94 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLGN3Q9NZ94 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLGN3Q9NZ94 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLGN3Q9NZ94 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLGN3Q9NZ94 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLGN3Q9NZ94 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLGN3Q9NZ94 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLGN3Q9NZ94 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLGN3Q9NZ94 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLGN3Q9NZ94 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLGN3Q9NZ94 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NLGN3Q9NZ94 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLGN3Q9NZ94 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLGN3Q9NZ94 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLGN3Q9NZ94 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLGN3Q9NZ94 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms