Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX43Q9NXZ2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX43Q9NXZ2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX43Q9NXZ2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX43Q9NXZ2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX43Q9NXZ2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX43Q9NXZ2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDX43Q9NXZ2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDX43Q9NXZ2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDX43Q9NXZ2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDX43Q9NXZ2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDX43Q9NXZ2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX43Q9NXZ2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX43Q9NXZ2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX43Q9NXZ2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX43Q9NXZ2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX43Q9NXZ2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDX43Q9NXZ2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDX43Q9NXZ2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDX43Q9NXZ2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDX43Q9NXZ2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDX43Q9NXZ2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDX43Q9NXZ2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
DDX43Q9NXZ2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX43Q9NXZ2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX43Q9NXZ2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX43Q9NXZ2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDX43Q9NXZ2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDX43Q9NXZ2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDX43Q9NXZ2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDX43Q9NXZ2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDX43Q9NXZ2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDX43Q9NXZ2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDX43Q9NXZ2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX43Q9NXZ2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX43Q9NXZ2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX43Q9NXZ2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX43Q9NXZ2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX43Q9NXZ2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX43Q9NXZ2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX43Q9NXZ2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX43Q9NXZ2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX43Q9NXZ2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX43Q9NXZ2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX43Q9NXZ2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX43Q9NXZ2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX43Q9NXZ2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX43Q9NXZ2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX43Q9NXZ2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX43Q9NXZ2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX43Q9NXZ2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX43Q9NXZ2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX43Q9NXZ2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX43Q9NXZ2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX43Q9NXZ2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX43Q9NXZ2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX43Q9NXZ2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX43Q9NXZ2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX43Q9NXZ2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX43Q9NXZ2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX43Q9NXZ2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX43Q9NXZ2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX43Q9NXZ2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX43Q9NXZ2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX43Q9NXZ2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX43Q9NXZ2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX43Q9NXZ2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX43Q9NXZ2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX43Q9NXZ2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX43Q9NXZ2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX43Q9NXZ2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX43Q9NXZ2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX43Q9NXZ2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX43Q9NXZ2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX43Q9NXZ2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX43Q9NXZ2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX43Q9NXZ2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX43Q9NXZ2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX43Q9NXZ2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX43Q9NXZ2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX43Q9NXZ2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX43Q9NXZ2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX43Q9NXZ2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX43Q9NXZ2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX43Q9NXZ2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX43Q9NXZ2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX43Q9NXZ2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX43Q9NXZ2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX43Q9NXZ2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX43Q9NXZ2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX43Q9NXZ2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX43Q9NXZ2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX43Q9NXZ2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX43Q9NXZ2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX43Q9NXZ2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX43Q9NXZ2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX43Q9NXZ2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX43Q9NXZ2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX43Q9NXZ2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX43Q9NXZ2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms