Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOR4AQ9NXH8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOR4AQ9NXH8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOR4AQ9NXH8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOR4AQ9NXH8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TOR4AQ9NXH8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOR4AQ9NXH8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOR4AQ9NXH8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOR4AQ9NXH8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOR4AQ9NXH8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOR4AQ9NXH8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOR4AQ9NXH8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOR4AQ9NXH8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOR4AQ9NXH8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOR4AQ9NXH8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOR4AQ9NXH8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOR4AQ9NXH8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOR4AQ9NXH8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOR4AQ9NXH8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOR4AQ9NXH8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOR4AQ9NXH8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOR4AQ9NXH8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOR4AQ9NXH8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOR4AQ9NXH8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOR4AQ9NXH8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOR4AQ9NXH8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOR4AQ9NXH8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOR4AQ9NXH8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOR4AQ9NXH8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOR4AQ9NXH8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOR4AQ9NXH8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOR4AQ9NXH8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOR4AQ9NXH8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOR4AQ9NXH8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TOR4AQ9NXH8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TOR4AQ9NXH8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TOR4AQ9NXH8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TOR4AQ9NXH8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOR4AQ9NXH8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOR4AQ9NXH8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOR4AQ9NXH8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOR4AQ9NXH8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOR4AQ9NXH8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOR4AQ9NXH8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOR4AQ9NXH8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOR4AQ9NXH8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOR4AQ9NXH8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TOR4AQ9NXH8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOR4AQ9NXH8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOR4AQ9NXH8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOR4AQ9NXH8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOR4AQ9NXH8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOR4AQ9NXH8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TOR4AQ9NXH8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOR4AQ9NXH8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOR4AQ9NXH8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOR4AQ9NXH8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOR4AQ9NXH8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOR4AQ9NXH8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOR4AQ9NXH8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOR4AQ9NXH8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOR4AQ9NXH8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOR4AQ9NXH8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOR4AQ9NXH8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOR4AQ9NXH8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TOR4AQ9NXH8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOR4AQ9NXH8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOR4AQ9NXH8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOR4AQ9NXH8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOR4AQ9NXH8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOR4AQ9NXH8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TOR4AQ9NXH8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TOR4AQ9NXH8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOR4AQ9NXH8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOR4AQ9NXH8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOR4AQ9NXH8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOR4AQ9NXH8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOR4AQ9NXH8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOR4AQ9NXH8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TOR4AQ9NXH8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TOR4AQ9NXH8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TOR4AQ9NXH8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOR4AQ9NXH8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOR4AQ9NXH8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOR4AQ9NXH8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOR4AQ9NXH8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOR4AQ9NXH8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TOR4AQ9NXH8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOR4AQ9NXH8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TOR4AQ9NXH8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TOR4AQ9NXH8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOR4AQ9NXH8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOR4AQ9NXH8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOR4AQ9NXH8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOR4AQ9NXH8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOR4AQ9NXH8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOR4AQ9NXH8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOR4AQ9NXH8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOR4AQ9NXH8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOR4AQ9NXH8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms