Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THUMPD1Q9NXG2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THUMPD1Q9NXG2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THUMPD1Q9NXG2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
THUMPD1Q9NXG2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
THUMPD1Q9NXG2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THUMPD1Q9NXG2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
THUMPD1Q9NXG2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
THUMPD1Q9NXG2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THUMPD1Q9NXG2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
THUMPD1Q9NXG2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
THUMPD1Q9NXG2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
THUMPD1Q9NXG2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THUMPD1Q9NXG2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
THUMPD1Q9NXG2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
THUMPD1Q9NXG2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THUMPD1Q9NXG2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THUMPD1Q9NXG2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
THUMPD1Q9NXG2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THUMPD1Q9NXG2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
THUMPD1Q9NXG2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THUMPD1Q9NXG2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THUMPD1Q9NXG2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THUMPD1Q9NXG2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THUMPD1Q9NXG2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THUMPD1Q9NXG2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
THUMPD1Q9NXG2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
THUMPD1Q9NXG2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THUMPD1Q9NXG2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
THUMPD1Q9NXG2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THUMPD1Q9NXG2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THUMPD1Q9NXG2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THUMPD1Q9NXG2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THUMPD1Q9NXG2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THUMPD1Q9NXG2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THUMPD1Q9NXG2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THUMPD1Q9NXG2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THUMPD1Q9NXG2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THUMPD1Q9NXG2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THUMPD1Q9NXG2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THUMPD1Q9NXG2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THUMPD1Q9NXG2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THUMPD1Q9NXG2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THUMPD1Q9NXG2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THUMPD1Q9NXG2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THUMPD1Q9NXG2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THUMPD1Q9NXG2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THUMPD1Q9NXG2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THUMPD1Q9NXG2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
THUMPD1Q9NXG2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
THUMPD1Q9NXG2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
THUMPD1Q9NXG2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
THUMPD1Q9NXG2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
THUMPD1Q9NXG2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
THUMPD1Q9NXG2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
THUMPD1Q9NXG2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
THUMPD1Q9NXG2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THUMPD1Q9NXG2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
THUMPD1Q9NXG2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THUMPD1Q9NXG2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THUMPD1Q9NXG2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THUMPD1Q9NXG2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THUMPD1Q9NXG2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
THUMPD1Q9NXG2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THUMPD1Q9NXG2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THUMPD1Q9NXG2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THUMPD1Q9NXG2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THUMPD1Q9NXG2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THUMPD1Q9NXG2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
THUMPD1Q9NXG2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
THUMPD1Q9NXG2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THUMPD1Q9NXG2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
THUMPD1Q9NXG2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THUMPD1Q9NXG2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THUMPD1Q9NXG2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THUMPD1Q9NXG2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THUMPD1Q9NXG2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THUMPD1Q9NXG2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THUMPD1Q9NXG2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THUMPD1Q9NXG2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THUMPD1Q9NXG2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THUMPD1Q9NXG2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
THUMPD1Q9NXG2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
THUMPD1Q9NXG2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THUMPD1Q9NXG2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THUMPD1Q9NXG2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THUMPD1Q9NXG2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
THUMPD1Q9NXG2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
THUMPD1Q9NXG2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
THUMPD1Q9NXG2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THUMPD1Q9NXG2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THUMPD1Q9NXG2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THUMPD1Q9NXG2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THUMPD1Q9NXG2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THUMPD1Q9NXG2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THUMPD1Q9NXG2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THUMPD1Q9NXG2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THUMPD1Q9NXG2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD1Q9NXG2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD1Q9NXG2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms