Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD3

SETD4, SET domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4Q9NVD3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD4Q9NVD3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SETD4Q9NVD3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD4Q9NVD3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD4Q9NVD3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETD4Q9NVD3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETD4Q9NVD3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETD4Q9NVD3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETD4Q9NVD3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETD4Q9NVD3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETD4Q9NVD3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SETD4Q9NVD3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETD4Q9NVD3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SETD4Q9NVD3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETD4Q9NVD3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETD4Q9NVD3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SETD4Q9NVD3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SETD4Q9NVD3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SETD4Q9NVD3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SETD4Q9NVD3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SETD4Q9NVD3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SETD4Q9NVD3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SETD4Q9NVD3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SETD4Q9NVD3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SETD4Q9NVD3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SETD4Q9NVD3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SETD4Q9NVD3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SETD4Q9NVD3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SETD4Q9NVD3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETD4Q9NVD3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETD4Q9NVD3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETD4Q9NVD3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETD4Q9NVD3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETD4Q9NVD3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETD4Q9NVD3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETD4Q9NVD3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETD4Q9NVD3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETD4Q9NVD3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETD4Q9NVD3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SETD4Q9NVD3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SETD4Q9NVD3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SETD4Q9NVD3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SETD4Q9NVD3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SETD4Q9NVD3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SETD4Q9NVD3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SETD4Q9NVD3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SETD4Q9NVD3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SETD4Q9NVD3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SETD4Q9NVD3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SETD4Q9NVD3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SETD4Q9NVD3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SETD4Q9NVD3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SETD4Q9NVD3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SETD4Q9NVD3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SETD4Q9NVD3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SETD4Q9NVD3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SETD4Q9NVD3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SETD4Q9NVD3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SETD4Q9NVD3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SETD4Q9NVD3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SETD4Q9NVD3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SETD4Q9NVD3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SETD4Q9NVD3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SETD4Q9NVD3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SETD4Q9NVD3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SETD4Q9NVD3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SETD4Q9NVD3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SETD4Q9NVD3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SETD4Q9NVD3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SETD4Q9NVD3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SETD4Q9NVD3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SETD4Q9NVD3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
SETD4Q9NVD3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SETD4Q9NVD3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SETD4Q9NVD3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SETD4Q9NVD3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SETD4Q9NVD3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SETD4Q9NVD3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SETD4Q9NVD3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SETD4Q9NVD3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SETD4Q9NVD3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SETD4Q9NVD3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SETD4Q9NVD3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SETD4Q9NVD3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SETD4Q9NVD3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SETD4Q9NVD3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SETD4Q9NVD3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SETD4Q9NVD3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SETD4Q9NVD3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SETD4Q9NVD3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SETD4Q9NVD3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SETD4Q9NVD3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SETD4Q9NVD3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SETD4Q9NVD3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SETD4Q9NVD3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SETD4Q9NVD3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SETD4Q9NVD3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SETD4Q9NVD3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SETD4Q9NVD3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SETD4Q9NVD3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms