Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUK0

MBNL3, Muscleblind-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBNL3Q9NUK0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MBNL3Q9NUK0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MBNL3Q9NUK0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MBNL3Q9NUK0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MBNL3Q9NUK0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MBNL3Q9NUK0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MBNL3Q9NUK0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MBNL3Q9NUK0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MBNL3Q9NUK0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MBNL3Q9NUK0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MBNL3Q9NUK0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MBNL3Q9NUK0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MBNL3Q9NUK0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MBNL3Q9NUK0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MBNL3Q9NUK0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MBNL3Q9NUK0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MBNL3Q9NUK0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MBNL3Q9NUK0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MBNL3Q9NUK0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MBNL3Q9NUK0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MBNL3Q9NUK0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MBNL3Q9NUK0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MBNL3Q9NUK0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MBNL3Q9NUK0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MBNL3Q9NUK0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MBNL3Q9NUK0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MBNL3Q9NUK0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
MBNL3Q9NUK0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MBNL3Q9NUK0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MBNL3Q9NUK0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MBNL3Q9NUK0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MBNL3Q9NUK0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
MBNL3Q9NUK0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MBNL3Q9NUK0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MBNL3Q9NUK0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MBNL3Q9NUK0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MBNL3Q9NUK0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MBNL3Q9NUK0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
MBNL3Q9NUK0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MBNL3Q9NUK0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MBNL3Q9NUK0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MBNL3Q9NUK0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MBNL3Q9NUK0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MBNL3Q9NUK0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MBNL3Q9NUK0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MBNL3Q9NUK0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MBNL3Q9NUK0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MBNL3Q9NUK0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MBNL3Q9NUK0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MBNL3Q9NUK0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MBNL3Q9NUK0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MBNL3Q9NUK0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MBNL3Q9NUK0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MBNL3Q9NUK0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MBNL3Q9NUK0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MBNL3Q9NUK0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MBNL3Q9NUK0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MBNL3Q9NUK0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MBNL3Q9NUK0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MBNL3Q9NUK0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MBNL3Q9NUK0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MBNL3Q9NUK0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MBNL3Q9NUK0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MBNL3Q9NUK0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MBNL3Q9NUK0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MBNL3Q9NUK0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MBNL3Q9NUK0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MBNL3Q9NUK0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MBNL3Q9NUK0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MBNL3Q9NUK0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MBNL3Q9NUK0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MBNL3Q9NUK0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MBNL3Q9NUK0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MBNL3Q9NUK0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MBNL3Q9NUK0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MBNL3Q9NUK0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MBNL3Q9NUK0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MBNL3Q9NUK0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MBNL3Q9NUK0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MBNL3Q9NUK0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MBNL3Q9NUK0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MBNL3Q9NUK0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MBNL3Q9NUK0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MBNL3Q9NUK0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MBNL3Q9NUK0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MBNL3Q9NUK0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MBNL3Q9NUK0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MBNL3Q9NUK0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MBNL3Q9NUK0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MBNL3Q9NUK0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MBNL3Q9NUK0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MBNL3Q9NUK0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MBNL3Q9NUK0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MBNL3Q9NUK0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MBNL3Q9NUK0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MBNL3Q9NUK0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MBNL3Q9NUK0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
MBNL3Q9NUK0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MBNL3Q9NUK0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MBNL3Q9NUK0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms