Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATP8A2Q9NTI2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATP8A2Q9NTI2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP8A2Q9NTI2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP8A2Q9NTI2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP8A2Q9NTI2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP8A2Q9NTI2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP8A2Q9NTI2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP8A2Q9NTI2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ATP8A2Q9NTI2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ATP8A2Q9NTI2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATP8A2Q9NTI2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATP8A2Q9NTI2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATP8A2Q9NTI2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ATP8A2Q9NTI2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ATP8A2Q9NTI2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ATP8A2Q9NTI2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ATP8A2Q9NTI2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ATP8A2Q9NTI2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP8A2Q9NTI2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP8A2Q9NTI2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP8A2Q9NTI2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP8A2Q9NTI2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP8A2Q9NTI2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP8A2Q9NTI2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP8A2Q9NTI2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP8A2Q9NTI2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP8A2Q9NTI2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATP8A2Q9NTI2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATP8A2Q9NTI2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATP8A2Q9NTI2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
ATP8A2Q9NTI2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATP8A2Q9NTI2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATP8A2Q9NTI2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATP8A2Q9NTI2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATP8A2Q9NTI2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATP8A2Q9NTI2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATP8A2Q9NTI2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ATP8A2Q9NTI2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATP8A2Q9NTI2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATP8A2Q9NTI2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATP8A2Q9NTI2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATP8A2Q9NTI2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATP8A2Q9NTI2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ATP8A2Q9NTI2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ATP8A2Q9NTI2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ATP8A2Q9NTI2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ATP8A2Q9NTI2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ATP8A2Q9NTI2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30■■■□□ 2.39
ATP8A2Q9NTI2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATP8A2Q9NTI2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
ATP8A2Q9NTI2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATP8A2Q9NTI2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATP8A2Q9NTI2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATP8A2Q9NTI2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATP8A2Q9NTI2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATP8A2Q9NTI2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP8A2Q9NTI2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP8A2Q9NTI2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATP8A2Q9NTI2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATP8A2Q9NTI2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATP8A2Q9NTI2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP8A2Q9NTI2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP8A2Q9NTI2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP8A2Q9NTI2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP8A2Q9NTI2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ATP8A2Q9NTI2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ATP8A2Q9NTI2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ATP8A2Q9NTI2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
ATP8A2Q9NTI2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ATP8A2Q9NTI2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ATP8A2Q9NTI2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ATP8A2Q9NTI2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ATP8A2Q9NTI2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
ATP8A2Q9NTI2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATP8A2Q9NTI2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATP8A2Q9NTI2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
ATP8A2Q9NTI2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATP8A2Q9NTI2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATP8A2Q9NTI2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATP8A2Q9NTI2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATP8A2Q9NTI2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATP8A2Q9NTI2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATP8A2Q9NTI2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATP8A2Q9NTI2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATP8A2Q9NTI2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATP8A2Q9NTI2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATP8A2Q9NTI2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATP8A2Q9NTI2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATP8A2Q9NTI2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATP8A2Q9NTI2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATP8A2Q9NTI2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
ATP8A2Q9NTI2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATP8A2Q9NTI2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
ATP8A2Q9NTI2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATP8A2Q9NTI2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATP8A2Q9NTI2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATP8A2Q9NTI2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATP8A2Q9NTI2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATP8A2Q9NTI2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms