Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EMILIN3Q9NT22 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EMILIN3Q9NT22 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
EMILIN3Q9NT22 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
EMILIN3Q9NT22 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
EMILIN3Q9NT22 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EMILIN3Q9NT22 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
EMILIN3Q9NT22 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
EMILIN3Q9NT22 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
EMILIN3Q9NT22 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
EMILIN3Q9NT22 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EMILIN3Q9NT22 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EMILIN3Q9NT22 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
EMILIN3Q9NT22 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
EMILIN3Q9NT22 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
EMILIN3Q9NT22 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
EMILIN3Q9NT22 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
EMILIN3Q9NT22 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
EMILIN3Q9NT22 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
EMILIN3Q9NT22 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
EMILIN3Q9NT22 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
EMILIN3Q9NT22 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
EMILIN3Q9NT22 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
EMILIN3Q9NT22 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EMILIN3Q9NT22 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
EMILIN3Q9NT22 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
EMILIN3Q9NT22 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
EMILIN3Q9NT22 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
EMILIN3Q9NT22 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
EMILIN3Q9NT22 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
EMILIN3Q9NT22 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
EMILIN3Q9NT22 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EMILIN3Q9NT22 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
EMILIN3Q9NT22 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
EMILIN3Q9NT22 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EMILIN3Q9NT22 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
EMILIN3Q9NT22 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
EMILIN3Q9NT22 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
EMILIN3Q9NT22 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EMILIN3Q9NT22 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EMILIN3Q9NT22 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EMILIN3Q9NT22 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EMILIN3Q9NT22 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EMILIN3Q9NT22 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EMILIN3Q9NT22 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EMILIN3Q9NT22 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EMILIN3Q9NT22 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EMILIN3Q9NT22 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EMILIN3Q9NT22 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EMILIN3Q9NT22 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EMILIN3Q9NT22 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EMILIN3Q9NT22 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EMILIN3Q9NT22 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EMILIN3Q9NT22 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EMILIN3Q9NT22 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EMILIN3Q9NT22 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EMILIN3Q9NT22 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EMILIN3Q9NT22 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EMILIN3Q9NT22 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EMILIN3Q9NT22 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
EMILIN3Q9NT22 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EMILIN3Q9NT22 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EMILIN3Q9NT22 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EMILIN3Q9NT22 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EMILIN3Q9NT22 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EMILIN3Q9NT22 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EMILIN3Q9NT22 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EMILIN3Q9NT22 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
EMILIN3Q9NT22 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
EMILIN3Q9NT22 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
EMILIN3Q9NT22 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EMILIN3Q9NT22 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EMILIN3Q9NT22 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
EMILIN3Q9NT22 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EMILIN3Q9NT22 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EMILIN3Q9NT22 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EMILIN3Q9NT22 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
EMILIN3Q9NT22 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
EMILIN3Q9NT22 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EMILIN3Q9NT22 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
EMILIN3Q9NT22 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
EMILIN3Q9NT22 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EMILIN3Q9NT22 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EMILIN3Q9NT22 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EMILIN3Q9NT22 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EMILIN3Q9NT22 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
EMILIN3Q9NT22 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
EMILIN3Q9NT22 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
EMILIN3Q9NT22 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
EMILIN3Q9NT22 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
EMILIN3Q9NT22 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EMILIN3Q9NT22 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
EMILIN3Q9NT22 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
EMILIN3Q9NT22 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EMILIN3Q9NT22 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EMILIN3Q9NT22 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EMILIN3Q9NT22 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EMILIN3Q9NT22 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
EMILIN3Q9NT22 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EMILIN3Q9NT22 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms