Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERINC1Q9NRX5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERINC1Q9NRX5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERINC1Q9NRX5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERINC1Q9NRX5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERINC1Q9NRX5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERINC1Q9NRX5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERINC1Q9NRX5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERINC1Q9NRX5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERINC1Q9NRX5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SERINC1Q9NRX5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SERINC1Q9NRX5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERINC1Q9NRX5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SERINC1Q9NRX5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SERINC1Q9NRX5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERINC1Q9NRX5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERINC1Q9NRX5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERINC1Q9NRX5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SERINC1Q9NRX5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERINC1Q9NRX5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERINC1Q9NRX5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERINC1Q9NRX5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERINC1Q9NRX5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SERINC1Q9NRX5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERINC1Q9NRX5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERINC1Q9NRX5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SERINC1Q9NRX5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERINC1Q9NRX5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERINC1Q9NRX5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERINC1Q9NRX5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERINC1Q9NRX5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERINC1Q9NRX5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERINC1Q9NRX5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERINC1Q9NRX5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERINC1Q9NRX5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERINC1Q9NRX5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SERINC1Q9NRX5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERINC1Q9NRX5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERINC1Q9NRX5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERINC1Q9NRX5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERINC1Q9NRX5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SERINC1Q9NRX5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERINC1Q9NRX5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERINC1Q9NRX5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERINC1Q9NRX5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERINC1Q9NRX5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SERINC1Q9NRX5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERINC1Q9NRX5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERINC1Q9NRX5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERINC1Q9NRX5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERINC1Q9NRX5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERINC1Q9NRX5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERINC1Q9NRX5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERINC1Q9NRX5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERINC1Q9NRX5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERINC1Q9NRX5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERINC1Q9NRX5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERINC1Q9NRX5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERINC1Q9NRX5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERINC1Q9NRX5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERINC1Q9NRX5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERINC1Q9NRX5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERINC1Q9NRX5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERINC1Q9NRX5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SERINC1Q9NRX5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERINC1Q9NRX5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERINC1Q9NRX5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERINC1Q9NRX5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERINC1Q9NRX5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERINC1Q9NRX5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERINC1Q9NRX5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERINC1Q9NRX5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERINC1Q9NRX5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERINC1Q9NRX5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERINC1Q9NRX5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERINC1Q9NRX5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERINC1Q9NRX5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERINC1Q9NRX5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERINC1Q9NRX5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERINC1Q9NRX5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERINC1Q9NRX5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERINC1Q9NRX5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERINC1Q9NRX5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERINC1Q9NRX5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERINC1Q9NRX5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SERINC1Q9NRX5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERINC1Q9NRX5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SERINC1Q9NRX5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERINC1Q9NRX5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERINC1Q9NRX5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERINC1Q9NRX5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SERINC1Q9NRX5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERINC1Q9NRX5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERINC1Q9NRX5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERINC1Q9NRX5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERINC1Q9NRX5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERINC1Q9NRX5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERINC1Q9NRX5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERINC1Q9NRX5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERINC1Q9NRX5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms