Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SH2B1Q9NRF2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SH2B1Q9NRF2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SH2B1Q9NRF2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SH2B1Q9NRF2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SH2B1Q9NRF2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SH2B1Q9NRF2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SH2B1Q9NRF2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SH2B1Q9NRF2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SH2B1Q9NRF2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SH2B1Q9NRF2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SH2B1Q9NRF2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SH2B1Q9NRF2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SH2B1Q9NRF2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SH2B1Q9NRF2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SH2B1Q9NRF2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SH2B1Q9NRF2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SH2B1Q9NRF2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SH2B1Q9NRF2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SH2B1Q9NRF2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SH2B1Q9NRF2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SH2B1Q9NRF2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SH2B1Q9NRF2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SH2B1Q9NRF2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SH2B1Q9NRF2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SH2B1Q9NRF2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SH2B1Q9NRF2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SH2B1Q9NRF2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SH2B1Q9NRF2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SH2B1Q9NRF2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SH2B1Q9NRF2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SH2B1Q9NRF2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SH2B1Q9NRF2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SH2B1Q9NRF2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SH2B1Q9NRF2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SH2B1Q9NRF2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SH2B1Q9NRF2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SH2B1Q9NRF2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SH2B1Q9NRF2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SH2B1Q9NRF2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SH2B1Q9NRF2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SH2B1Q9NRF2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SH2B1Q9NRF2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SH2B1Q9NRF2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SH2B1Q9NRF2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SH2B1Q9NRF2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SH2B1Q9NRF2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SH2B1Q9NRF2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SH2B1Q9NRF2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SH2B1Q9NRF2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SH2B1Q9NRF2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SH2B1Q9NRF2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SH2B1Q9NRF2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SH2B1Q9NRF2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SH2B1Q9NRF2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SH2B1Q9NRF2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SH2B1Q9NRF2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SH2B1Q9NRF2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SH2B1Q9NRF2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SH2B1Q9NRF2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SH2B1Q9NRF2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SH2B1Q9NRF2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SH2B1Q9NRF2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SH2B1Q9NRF2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SH2B1Q9NRF2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SH2B1Q9NRF2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SH2B1Q9NRF2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SH2B1Q9NRF2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SH2B1Q9NRF2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SH2B1Q9NRF2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SH2B1Q9NRF2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SH2B1Q9NRF2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SH2B1Q9NRF2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SH2B1Q9NRF2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SH2B1Q9NRF2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SH2B1Q9NRF2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SH2B1Q9NRF2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SH2B1Q9NRF2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SH2B1Q9NRF2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SH2B1Q9NRF2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SH2B1Q9NRF2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SH2B1Q9NRF2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SH2B1Q9NRF2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SH2B1Q9NRF2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SH2B1Q9NRF2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SH2B1Q9NRF2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SH2B1Q9NRF2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SH2B1Q9NRF2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SH2B1Q9NRF2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SH2B1Q9NRF2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SH2B1Q9NRF2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SH2B1Q9NRF2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SH2B1Q9NRF2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SH2B1Q9NRF2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SH2B1Q9NRF2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SH2B1Q9NRF2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SH2B1Q9NRF2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SH2B1Q9NRF2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SH2B1Q9NRF2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SH2B1Q9NRF2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms