Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA8

EIF4ENIF1, Eukaryotic translation initiation factor 4E transporter, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4ENIF1Q9NRA8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EIF4ENIF1Q9NRA8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EIF4ENIF1Q9NRA8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EIF4ENIF1Q9NRA8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EIF4ENIF1Q9NRA8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EIF4ENIF1Q9NRA8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EIF4ENIF1Q9NRA8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EIF4ENIF1Q9NRA8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EIF4ENIF1Q9NRA8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
EIF4ENIF1Q9NRA8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EIF4ENIF1Q9NRA8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EIF4ENIF1Q9NRA8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EIF4ENIF1Q9NRA8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EIF4ENIF1Q9NRA8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EIF4ENIF1Q9NRA8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EIF4ENIF1Q9NRA8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EIF4ENIF1Q9NRA8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EIF4ENIF1Q9NRA8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EIF4ENIF1Q9NRA8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EIF4ENIF1Q9NRA8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EIF4ENIF1Q9NRA8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EIF4ENIF1Q9NRA8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EIF4ENIF1Q9NRA8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EIF4ENIF1Q9NRA8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EIF4ENIF1Q9NRA8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EIF4ENIF1Q9NRA8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EIF4ENIF1Q9NRA8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EIF4ENIF1Q9NRA8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EIF4ENIF1Q9NRA8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EIF4ENIF1Q9NRA8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EIF4ENIF1Q9NRA8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EIF4ENIF1Q9NRA8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EIF4ENIF1Q9NRA8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
EIF4ENIF1Q9NRA8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
EIF4ENIF1Q9NRA8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EIF4ENIF1Q9NRA8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EIF4ENIF1Q9NRA8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EIF4ENIF1Q9NRA8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
EIF4ENIF1Q9NRA8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EIF4ENIF1Q9NRA8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
EIF4ENIF1Q9NRA8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
EIF4ENIF1Q9NRA8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EIF4ENIF1Q9NRA8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EIF4ENIF1Q9NRA8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EIF4ENIF1Q9NRA8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EIF4ENIF1Q9NRA8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EIF4ENIF1Q9NRA8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EIF4ENIF1Q9NRA8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EIF4ENIF1Q9NRA8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EIF4ENIF1Q9NRA8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EIF4ENIF1Q9NRA8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EIF4ENIF1Q9NRA8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
EIF4ENIF1Q9NRA8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
EIF4ENIF1Q9NRA8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
EIF4ENIF1Q9NRA8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
EIF4ENIF1Q9NRA8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
EIF4ENIF1Q9NRA8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
EIF4ENIF1Q9NRA8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
EIF4ENIF1Q9NRA8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
EIF4ENIF1Q9NRA8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
EIF4ENIF1Q9NRA8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
EIF4ENIF1Q9NRA8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
EIF4ENIF1Q9NRA8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
EIF4ENIF1Q9NRA8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
EIF4ENIF1Q9NRA8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EIF4ENIF1Q9NRA8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EIF4ENIF1Q9NRA8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EIF4ENIF1Q9NRA8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EIF4ENIF1Q9NRA8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EIF4ENIF1Q9NRA8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
EIF4ENIF1Q9NRA8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EIF4ENIF1Q9NRA8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EIF4ENIF1Q9NRA8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EIF4ENIF1Q9NRA8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EIF4ENIF1Q9NRA8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EIF4ENIF1Q9NRA8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EIF4ENIF1Q9NRA8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EIF4ENIF1Q9NRA8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EIF4ENIF1Q9NRA8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EIF4ENIF1Q9NRA8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EIF4ENIF1Q9NRA8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EIF4ENIF1Q9NRA8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EIF4ENIF1Q9NRA8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EIF4ENIF1Q9NRA8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EIF4ENIF1Q9NRA8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EIF4ENIF1Q9NRA8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EIF4ENIF1Q9NRA8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EIF4ENIF1Q9NRA8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms