Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR16

CD163L1, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M160, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163L1Q9NR16 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CD163L1Q9NR16 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CD163L1Q9NR16 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
CD163L1Q9NR16 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CD163L1Q9NR16 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
CD163L1Q9NR16 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CD163L1Q9NR16 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
CD163L1Q9NR16 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
CD163L1Q9NR16 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CD163L1Q9NR16 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CD163L1Q9NR16 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CD163L1Q9NR16 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
CD163L1Q9NR16 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CD163L1Q9NR16 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CD163L1Q9NR16 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CD163L1Q9NR16 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CD163L1Q9NR16 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CD163L1Q9NR16 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CD163L1Q9NR16 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CD163L1Q9NR16 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CD163L1Q9NR16 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CD163L1Q9NR16 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CD163L1Q9NR16 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CD163L1Q9NR16 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CD163L1Q9NR16 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CD163L1Q9NR16 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
CD163L1Q9NR16 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
CD163L1Q9NR16 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CD163L1Q9NR16 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CD163L1Q9NR16 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CD163L1Q9NR16 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CD163L1Q9NR16 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CD163L1Q9NR16 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CD163L1Q9NR16 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CD163L1Q9NR16 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CD163L1Q9NR16 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CD163L1Q9NR16 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CD163L1Q9NR16 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CD163L1Q9NR16 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CD163L1Q9NR16 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
CD163L1Q9NR16 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CD163L1Q9NR16 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CD163L1Q9NR16 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CD163L1Q9NR16 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CD163L1Q9NR16 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CD163L1Q9NR16 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CD163L1Q9NR16 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CD163L1Q9NR16 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CD163L1Q9NR16 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CD163L1Q9NR16 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CD163L1Q9NR16 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CD163L1Q9NR16 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CD163L1Q9NR16 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CD163L1Q9NR16 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CD163L1Q9NR16 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CD163L1Q9NR16 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CD163L1Q9NR16 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CD163L1Q9NR16 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CD163L1Q9NR16 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CD163L1Q9NR16 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
CD163L1Q9NR16 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CD163L1Q9NR16 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
CD163L1Q9NR16 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CD163L1Q9NR16 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CD163L1Q9NR16 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CD163L1Q9NR16 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CD163L1Q9NR16 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CD163L1Q9NR16 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CD163L1Q9NR16 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
CD163L1Q9NR16 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CD163L1Q9NR16 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CD163L1Q9NR16 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CD163L1Q9NR16 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CD163L1Q9NR16 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CD163L1Q9NR16 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CD163L1Q9NR16 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
CD163L1Q9NR16 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CD163L1Q9NR16 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
CD163L1Q9NR16 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CD163L1Q9NR16 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
CD163L1Q9NR16 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CD163L1Q9NR16 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CD163L1Q9NR16 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CD163L1Q9NR16 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CD163L1Q9NR16 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CD163L1Q9NR16 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CD163L1Q9NR16 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CD163L1Q9NR16 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CD163L1Q9NR16 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CD163L1Q9NR16 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CD163L1Q9NR16 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CD163L1Q9NR16 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CD163L1Q9NR16 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CD163L1Q9NR16 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CD163L1Q9NR16 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CD163L1Q9NR16 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CD163L1Q9NR16 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CD163L1Q9NR16 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CD163L1Q9NR16 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CD163L1Q9NR16 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms