Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG4

ATP6V0A4, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 4, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0A4Q9HBG4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP6V0A4Q9HBG4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP6V0A4Q9HBG4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP6V0A4Q9HBG4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP6V0A4Q9HBG4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP6V0A4Q9HBG4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP6V0A4Q9HBG4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP6V0A4Q9HBG4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP6V0A4Q9HBG4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP6V0A4Q9HBG4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP6V0A4Q9HBG4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP6V0A4Q9HBG4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP6V0A4Q9HBG4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP6V0A4Q9HBG4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP6V0A4Q9HBG4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP6V0A4Q9HBG4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP6V0A4Q9HBG4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP6V0A4Q9HBG4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP6V0A4Q9HBG4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP6V0A4Q9HBG4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP6V0A4Q9HBG4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP6V0A4Q9HBG4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP6V0A4Q9HBG4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP6V0A4Q9HBG4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP6V0A4Q9HBG4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP6V0A4Q9HBG4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP6V0A4Q9HBG4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP6V0A4Q9HBG4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP6V0A4Q9HBG4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP6V0A4Q9HBG4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP6V0A4Q9HBG4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP6V0A4Q9HBG4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP6V0A4Q9HBG4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP6V0A4Q9HBG4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP6V0A4Q9HBG4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP6V0A4Q9HBG4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP6V0A4Q9HBG4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP6V0A4Q9HBG4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP6V0A4Q9HBG4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP6V0A4Q9HBG4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP6V0A4Q9HBG4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP6V0A4Q9HBG4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP6V0A4Q9HBG4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP6V0A4Q9HBG4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP6V0A4Q9HBG4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP6V0A4Q9HBG4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP6V0A4Q9HBG4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP6V0A4Q9HBG4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP6V0A4Q9HBG4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP6V0A4Q9HBG4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP6V0A4Q9HBG4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP6V0A4Q9HBG4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP6V0A4Q9HBG4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP6V0A4Q9HBG4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP6V0A4Q9HBG4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP6V0A4Q9HBG4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP6V0A4Q9HBG4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP6V0A4Q9HBG4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP6V0A4Q9HBG4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP6V0A4Q9HBG4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP6V0A4Q9HBG4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATP6V0A4Q9HBG4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATP6V0A4Q9HBG4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP6V0A4Q9HBG4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP6V0A4Q9HBG4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP6V0A4Q9HBG4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP6V0A4Q9HBG4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP6V0A4Q9HBG4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP6V0A4Q9HBG4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP6V0A4Q9HBG4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP6V0A4Q9HBG4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP6V0A4Q9HBG4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP6V0A4Q9HBG4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP6V0A4Q9HBG4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP6V0A4Q9HBG4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP6V0A4Q9HBG4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP6V0A4Q9HBG4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP6V0A4Q9HBG4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP6V0A4Q9HBG4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP6V0A4Q9HBG4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP6V0A4Q9HBG4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP6V0A4Q9HBG4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP6V0A4Q9HBG4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP6V0A4Q9HBG4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP6V0A4Q9HBG4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATP6V0A4Q9HBG4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP6V0A4Q9HBG4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP6V0A4Q9HBG4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP6V0A4Q9HBG4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP6V0A4Q9HBG4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP6V0A4Q9HBG4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP6V0A4Q9HBG4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP6V0A4Q9HBG4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP6V0A4Q9HBG4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP6V0A4Q9HBG4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP6V0A4Q9HBG4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP6V0A4Q9HBG4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP6V0A4Q9HBG4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP6V0A4Q9HBG4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP6V0A4Q9HBG4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms