Protein–RNA interactions for Protein: Q9H816

DCLRE1B, 5' exonuclease Apollo, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1BQ9H816 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCLRE1BQ9H816 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCLRE1BQ9H816 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCLRE1BQ9H816 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DCLRE1BQ9H816 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DCLRE1BQ9H816 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCLRE1BQ9H816 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCLRE1BQ9H816 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCLRE1BQ9H816 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCLRE1BQ9H816 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCLRE1BQ9H816 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCLRE1BQ9H816 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCLRE1BQ9H816 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCLRE1BQ9H816 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCLRE1BQ9H816 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCLRE1BQ9H816 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCLRE1BQ9H816 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCLRE1BQ9H816 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCLRE1BQ9H816 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCLRE1BQ9H816 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCLRE1BQ9H816 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCLRE1BQ9H816 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DCLRE1BQ9H816 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCLRE1BQ9H816 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCLRE1BQ9H816 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCLRE1BQ9H816 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCLRE1BQ9H816 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DCLRE1BQ9H816 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCLRE1BQ9H816 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DCLRE1BQ9H816 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCLRE1BQ9H816 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCLRE1BQ9H816 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCLRE1BQ9H816 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCLRE1BQ9H816 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCLRE1BQ9H816 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCLRE1BQ9H816 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCLRE1BQ9H816 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCLRE1BQ9H816 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCLRE1BQ9H816 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCLRE1BQ9H816 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCLRE1BQ9H816 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCLRE1BQ9H816 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCLRE1BQ9H816 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCLRE1BQ9H816 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCLRE1BQ9H816 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCLRE1BQ9H816 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DCLRE1BQ9H816 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCLRE1BQ9H816 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCLRE1BQ9H816 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCLRE1BQ9H816 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCLRE1BQ9H816 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCLRE1BQ9H816 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCLRE1BQ9H816 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCLRE1BQ9H816 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCLRE1BQ9H816 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCLRE1BQ9H816 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCLRE1BQ9H816 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCLRE1BQ9H816 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DCLRE1BQ9H816 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DCLRE1BQ9H816 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DCLRE1BQ9H816 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DCLRE1BQ9H816 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DCLRE1BQ9H816 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DCLRE1BQ9H816 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DCLRE1BQ9H816 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DCLRE1BQ9H816 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DCLRE1BQ9H816 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DCLRE1BQ9H816 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DCLRE1BQ9H816 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DCLRE1BQ9H816 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DCLRE1BQ9H816 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DCLRE1BQ9H816 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DCLRE1BQ9H816 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DCLRE1BQ9H816 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DCLRE1BQ9H816 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DCLRE1BQ9H816 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DCLRE1BQ9H816 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DCLRE1BQ9H816 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DCLRE1BQ9H816 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DCLRE1BQ9H816 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DCLRE1BQ9H816 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DCLRE1BQ9H816 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DCLRE1BQ9H816 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DCLRE1BQ9H816 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DCLRE1BQ9H816 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCLRE1BQ9H816 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCLRE1BQ9H816 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DCLRE1BQ9H816 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCLRE1BQ9H816 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCLRE1BQ9H816 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCLRE1BQ9H816 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCLRE1BQ9H816 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DCLRE1BQ9H816 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCLRE1BQ9H816 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCLRE1BQ9H816 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCLRE1BQ9H816 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCLRE1BQ9H816 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCLRE1BQ9H816 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCLRE1BQ9H816 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCLRE1BQ9H816 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms