Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L7

SMARCAD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCAD1Q9H4L7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMARCAD1Q9H4L7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMARCAD1Q9H4L7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMARCAD1Q9H4L7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMARCAD1Q9H4L7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCAD1Q9H4L7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCAD1Q9H4L7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCAD1Q9H4L7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCAD1Q9H4L7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCAD1Q9H4L7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCAD1Q9H4L7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCAD1Q9H4L7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCAD1Q9H4L7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCAD1Q9H4L7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCAD1Q9H4L7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCAD1Q9H4L7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCAD1Q9H4L7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCAD1Q9H4L7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCAD1Q9H4L7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCAD1Q9H4L7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMARCAD1Q9H4L7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMARCAD1Q9H4L7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMARCAD1Q9H4L7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SMARCAD1Q9H4L7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SMARCAD1Q9H4L7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCAD1Q9H4L7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCAD1Q9H4L7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCAD1Q9H4L7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCAD1Q9H4L7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCAD1Q9H4L7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCAD1Q9H4L7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCAD1Q9H4L7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCAD1Q9H4L7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCAD1Q9H4L7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCAD1Q9H4L7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCAD1Q9H4L7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCAD1Q9H4L7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCAD1Q9H4L7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCAD1Q9H4L7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCAD1Q9H4L7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCAD1Q9H4L7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SMARCAD1Q9H4L7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCAD1Q9H4L7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCAD1Q9H4L7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCAD1Q9H4L7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCAD1Q9H4L7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCAD1Q9H4L7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCAD1Q9H4L7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCAD1Q9H4L7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCAD1Q9H4L7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCAD1Q9H4L7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCAD1Q9H4L7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCAD1Q9H4L7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCAD1Q9H4L7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCAD1Q9H4L7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCAD1Q9H4L7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCAD1Q9H4L7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCAD1Q9H4L7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCAD1Q9H4L7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCAD1Q9H4L7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCAD1Q9H4L7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCAD1Q9H4L7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCAD1Q9H4L7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCAD1Q9H4L7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCAD1Q9H4L7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCAD1Q9H4L7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCAD1Q9H4L7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCAD1Q9H4L7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCAD1Q9H4L7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCAD1Q9H4L7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SMARCAD1Q9H4L7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCAD1Q9H4L7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCAD1Q9H4L7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCAD1Q9H4L7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCAD1Q9H4L7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCAD1Q9H4L7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCAD1Q9H4L7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCAD1Q9H4L7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCAD1Q9H4L7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCAD1Q9H4L7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCAD1Q9H4L7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCAD1Q9H4L7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCAD1Q9H4L7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCAD1Q9H4L7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCAD1Q9H4L7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCAD1Q9H4L7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCAD1Q9H4L7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCAD1Q9H4L7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCAD1Q9H4L7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCAD1Q9H4L7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCAD1Q9H4L7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCAD1Q9H4L7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCAD1Q9H4L7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCAD1Q9H4L7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SMARCAD1Q9H4L7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCAD1Q9H4L7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCAD1Q9H4L7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCAD1Q9H4L7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCAD1Q9H4L7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCAD1Q9H4L7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms