Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T3

SEMA6B, Semaphorin-6B, humanhuman

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6BQ9H3T3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SEMA6BQ9H3T3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SEMA6BQ9H3T3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SEMA6BQ9H3T3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SEMA6BQ9H3T3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SEMA6BQ9H3T3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEMA6BQ9H3T3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEMA6BQ9H3T3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SEMA6BQ9H3T3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEMA6BQ9H3T3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEMA6BQ9H3T3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEMA6BQ9H3T3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEMA6BQ9H3T3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEMA6BQ9H3T3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEMA6BQ9H3T3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEMA6BQ9H3T3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEMA6BQ9H3T3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEMA6BQ9H3T3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEMA6BQ9H3T3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEMA6BQ9H3T3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEMA6BQ9H3T3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEMA6BQ9H3T3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEMA6BQ9H3T3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SEMA6BQ9H3T3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SEMA6BQ9H3T3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SEMA6BQ9H3T3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SEMA6BQ9H3T3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SEMA6BQ9H3T3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SEMA6BQ9H3T3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SEMA6BQ9H3T3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SEMA6BQ9H3T3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SEMA6BQ9H3T3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SEMA6BQ9H3T3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SEMA6BQ9H3T3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEMA6BQ9H3T3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEMA6BQ9H3T3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEMA6BQ9H3T3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEMA6BQ9H3T3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEMA6BQ9H3T3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEMA6BQ9H3T3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEMA6BQ9H3T3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SEMA6BQ9H3T3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEMA6BQ9H3T3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEMA6BQ9H3T3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SEMA6BQ9H3T3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SEMA6BQ9H3T3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SEMA6BQ9H3T3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEMA6BQ9H3T3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEMA6BQ9H3T3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEMA6BQ9H3T3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEMA6BQ9H3T3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SEMA6BQ9H3T3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SEMA6BQ9H3T3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SEMA6BQ9H3T3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SEMA6BQ9H3T3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SEMA6BQ9H3T3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SEMA6BQ9H3T3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SEMA6BQ9H3T3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SEMA6BQ9H3T3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SEMA6BQ9H3T3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SEMA6BQ9H3T3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEMA6BQ9H3T3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEMA6BQ9H3T3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEMA6BQ9H3T3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SEMA6BQ9H3T3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SEMA6BQ9H3T3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SEMA6BQ9H3T3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SEMA6BQ9H3T3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SEMA6BQ9H3T3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SEMA6BQ9H3T3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SEMA6BQ9H3T3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SEMA6BQ9H3T3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SEMA6BQ9H3T3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SEMA6BQ9H3T3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SEMA6BQ9H3T3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SEMA6BQ9H3T3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SEMA6BQ9H3T3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SEMA6BQ9H3T3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SEMA6BQ9H3T3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SEMA6BQ9H3T3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SEMA6BQ9H3T3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SEMA6BQ9H3T3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SEMA6BQ9H3T3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SEMA6BQ9H3T3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SEMA6BQ9H3T3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SEMA6BQ9H3T3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEMA6BQ9H3T3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEMA6BQ9H3T3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEMA6BQ9H3T3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEMA6BQ9H3T3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEMA6BQ9H3T3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEMA6BQ9H3T3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEMA6BQ9H3T3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SEMA6BQ9H3T3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SEMA6BQ9H3T3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SEMA6BQ9H3T3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SEMA6BQ9H3T3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SEMA6BQ9H3T3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SEMA6BQ9H3T3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SEMA6BQ9H3T3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111 ms