Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Y0

ATG10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG10Q9H0Y0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG10Q9H0Y0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG10Q9H0Y0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG10Q9H0Y0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG10Q9H0Y0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG10Q9H0Y0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG10Q9H0Y0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG10Q9H0Y0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG10Q9H0Y0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG10Q9H0Y0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG10Q9H0Y0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG10Q9H0Y0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG10Q9H0Y0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG10Q9H0Y0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG10Q9H0Y0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG10Q9H0Y0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG10Q9H0Y0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG10Q9H0Y0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG10Q9H0Y0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG10Q9H0Y0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG10Q9H0Y0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG10Q9H0Y0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG10Q9H0Y0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG10Q9H0Y0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG10Q9H0Y0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG10Q9H0Y0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG10Q9H0Y0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG10Q9H0Y0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG10Q9H0Y0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG10Q9H0Y0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG10Q9H0Y0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG10Q9H0Y0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG10Q9H0Y0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG10Q9H0Y0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG10Q9H0Y0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG10Q9H0Y0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG10Q9H0Y0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG10Q9H0Y0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG10Q9H0Y0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG10Q9H0Y0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG10Q9H0Y0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG10Q9H0Y0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG10Q9H0Y0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG10Q9H0Y0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG10Q9H0Y0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG10Q9H0Y0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG10Q9H0Y0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG10Q9H0Y0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG10Q9H0Y0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG10Q9H0Y0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG10Q9H0Y0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG10Q9H0Y0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG10Q9H0Y0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG10Q9H0Y0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG10Q9H0Y0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATG10Q9H0Y0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATG10Q9H0Y0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG10Q9H0Y0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG10Q9H0Y0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG10Q9H0Y0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG10Q9H0Y0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG10Q9H0Y0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG10Q9H0Y0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG10Q9H0Y0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG10Q9H0Y0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG10Q9H0Y0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG10Q9H0Y0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG10Q9H0Y0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG10Q9H0Y0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG10Q9H0Y0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG10Q9H0Y0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG10Q9H0Y0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG10Q9H0Y0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG10Q9H0Y0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG10Q9H0Y0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG10Q9H0Y0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG10Q9H0Y0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG10Q9H0Y0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG10Q9H0Y0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG10Q9H0Y0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG10Q9H0Y0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG10Q9H0Y0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG10Q9H0Y0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG10Q9H0Y0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG10Q9H0Y0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG10Q9H0Y0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG10Q9H0Y0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG10Q9H0Y0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG10Q9H0Y0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG10Q9H0Y0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG10Q9H0Y0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG10Q9H0Y0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG10Q9H0Y0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG10Q9H0Y0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG10Q9H0Y0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG10Q9H0Y0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG10Q9H0Y0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG10Q9H0Y0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG10Q9H0Y0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG10Q9H0Y0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms