Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0H3

KLHL25, Kelch-like protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL25Q9H0H3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL25Q9H0H3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL25Q9H0H3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL25Q9H0H3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL25Q9H0H3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL25Q9H0H3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL25Q9H0H3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL25Q9H0H3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL25Q9H0H3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL25Q9H0H3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL25Q9H0H3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL25Q9H0H3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL25Q9H0H3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL25Q9H0H3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KLHL25Q9H0H3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL25Q9H0H3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL25Q9H0H3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL25Q9H0H3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL25Q9H0H3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL25Q9H0H3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL25Q9H0H3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL25Q9H0H3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL25Q9H0H3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL25Q9H0H3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL25Q9H0H3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL25Q9H0H3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL25Q9H0H3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL25Q9H0H3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL25Q9H0H3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL25Q9H0H3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL25Q9H0H3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL25Q9H0H3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL25Q9H0H3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL25Q9H0H3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL25Q9H0H3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL25Q9H0H3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL25Q9H0H3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL25Q9H0H3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL25Q9H0H3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL25Q9H0H3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL25Q9H0H3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL25Q9H0H3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL25Q9H0H3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL25Q9H0H3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL25Q9H0H3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL25Q9H0H3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL25Q9H0H3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL25Q9H0H3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL25Q9H0H3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL25Q9H0H3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL25Q9H0H3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL25Q9H0H3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL25Q9H0H3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL25Q9H0H3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL25Q9H0H3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL25Q9H0H3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL25Q9H0H3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL25Q9H0H3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms