Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZB8

CPEB1, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1Q9BZB8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPEB1Q9BZB8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPEB1Q9BZB8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPEB1Q9BZB8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CPEB1Q9BZB8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPEB1Q9BZB8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPEB1Q9BZB8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPEB1Q9BZB8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPEB1Q9BZB8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPEB1Q9BZB8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPEB1Q9BZB8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CPEB1Q9BZB8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CPEB1Q9BZB8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPEB1Q9BZB8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPEB1Q9BZB8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPEB1Q9BZB8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPEB1Q9BZB8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPEB1Q9BZB8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPEB1Q9BZB8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPEB1Q9BZB8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CPEB1Q9BZB8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPEB1Q9BZB8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPEB1Q9BZB8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPEB1Q9BZB8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPEB1Q9BZB8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPEB1Q9BZB8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CPEB1Q9BZB8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPEB1Q9BZB8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPEB1Q9BZB8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPEB1Q9BZB8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPEB1Q9BZB8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPEB1Q9BZB8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPEB1Q9BZB8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPEB1Q9BZB8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPEB1Q9BZB8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPEB1Q9BZB8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPEB1Q9BZB8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CPEB1Q9BZB8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPEB1Q9BZB8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CPEB1Q9BZB8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CPEB1Q9BZB8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPEB1Q9BZB8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPEB1Q9BZB8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPEB1Q9BZB8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPEB1Q9BZB8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPEB1Q9BZB8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPEB1Q9BZB8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPEB1Q9BZB8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CPEB1Q9BZB8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPEB1Q9BZB8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPEB1Q9BZB8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPEB1Q9BZB8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPEB1Q9BZB8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPEB1Q9BZB8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPEB1Q9BZB8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPEB1Q9BZB8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPEB1Q9BZB8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPEB1Q9BZB8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPEB1Q9BZB8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPEB1Q9BZB8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPEB1Q9BZB8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPEB1Q9BZB8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPEB1Q9BZB8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPEB1Q9BZB8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPEB1Q9BZB8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPEB1Q9BZB8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPEB1Q9BZB8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPEB1Q9BZB8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPEB1Q9BZB8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CPEB1Q9BZB8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPEB1Q9BZB8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPEB1Q9BZB8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPEB1Q9BZB8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPEB1Q9BZB8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPEB1Q9BZB8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPEB1Q9BZB8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPEB1Q9BZB8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPEB1Q9BZB8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPEB1Q9BZB8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPEB1Q9BZB8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPEB1Q9BZB8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPEB1Q9BZB8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPEB1Q9BZB8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPEB1Q9BZB8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPEB1Q9BZB8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPEB1Q9BZB8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPEB1Q9BZB8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPEB1Q9BZB8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CPEB1Q9BZB8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CPEB1Q9BZB8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPEB1Q9BZB8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPEB1Q9BZB8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPEB1Q9BZB8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPEB1Q9BZB8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPEB1Q9BZB8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPEB1Q9BZB8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPEB1Q9BZB8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPEB1Q9BZB8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPEB1Q9BZB8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPEB1Q9BZB8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms