Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRRTQ9BXP5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
SRRTQ9BXP5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRRTQ9BXP5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRRTQ9BXP5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRRTQ9BXP5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRRTQ9BXP5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRRTQ9BXP5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRRTQ9BXP5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRRTQ9BXP5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRRTQ9BXP5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRRTQ9BXP5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRRTQ9BXP5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRRTQ9BXP5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRRTQ9BXP5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SRRTQ9BXP5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRRTQ9BXP5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRRTQ9BXP5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRRTQ9BXP5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRRTQ9BXP5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRRTQ9BXP5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRRTQ9BXP5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRRTQ9BXP5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRRTQ9BXP5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRRTQ9BXP5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SRRTQ9BXP5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRRTQ9BXP5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRRTQ9BXP5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRRTQ9BXP5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRRTQ9BXP5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRRTQ9BXP5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRRTQ9BXP5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SRRTQ9BXP5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRRTQ9BXP5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRRTQ9BXP5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRRTQ9BXP5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRRTQ9BXP5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRRTQ9BXP5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRRTQ9BXP5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRRTQ9BXP5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRRTQ9BXP5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRRTQ9BXP5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRRTQ9BXP5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRRTQ9BXP5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRRTQ9BXP5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRRTQ9BXP5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRRTQ9BXP5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRRTQ9BXP5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRRTQ9BXP5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRRTQ9BXP5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRRTQ9BXP5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRRTQ9BXP5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SRRTQ9BXP5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SRRTQ9BXP5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SRRTQ9BXP5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRRTQ9BXP5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRRTQ9BXP5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRRTQ9BXP5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRRTQ9BXP5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRRTQ9BXP5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRRTQ9BXP5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRRTQ9BXP5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRRTQ9BXP5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRRTQ9BXP5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRRTQ9BXP5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRRTQ9BXP5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRRTQ9BXP5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRRTQ9BXP5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRRTQ9BXP5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRRTQ9BXP5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRRTQ9BXP5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SRRTQ9BXP5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRRTQ9BXP5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRRTQ9BXP5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SRRTQ9BXP5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRRTQ9BXP5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRRTQ9BXP5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRRTQ9BXP5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRRTQ9BXP5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRRTQ9BXP5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRRTQ9BXP5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRRTQ9BXP5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRRTQ9BXP5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRRTQ9BXP5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRRTQ9BXP5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRRTQ9BXP5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRRTQ9BXP5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SRRTQ9BXP5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRRTQ9BXP5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRRTQ9BXP5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRRTQ9BXP5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRRTQ9BXP5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRRTQ9BXP5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SRRTQ9BXP5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRRTQ9BXP5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRRTQ9BXP5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRRTQ9BXP5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRRTQ9BXP5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRRTQ9BXP5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRRTQ9BXP5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms