Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB1

LGR4, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR4Q9BXB1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LGR4Q9BXB1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LGR4Q9BXB1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LGR4Q9BXB1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LGR4Q9BXB1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LGR4Q9BXB1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LGR4Q9BXB1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LGR4Q9BXB1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LGR4Q9BXB1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LGR4Q9BXB1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LGR4Q9BXB1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LGR4Q9BXB1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LGR4Q9BXB1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LGR4Q9BXB1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LGR4Q9BXB1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LGR4Q9BXB1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LGR4Q9BXB1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LGR4Q9BXB1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LGR4Q9BXB1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LGR4Q9BXB1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LGR4Q9BXB1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LGR4Q9BXB1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LGR4Q9BXB1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LGR4Q9BXB1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LGR4Q9BXB1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LGR4Q9BXB1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LGR4Q9BXB1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LGR4Q9BXB1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LGR4Q9BXB1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LGR4Q9BXB1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LGR4Q9BXB1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LGR4Q9BXB1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LGR4Q9BXB1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LGR4Q9BXB1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LGR4Q9BXB1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LGR4Q9BXB1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LGR4Q9BXB1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LGR4Q9BXB1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LGR4Q9BXB1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LGR4Q9BXB1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LGR4Q9BXB1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LGR4Q9BXB1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LGR4Q9BXB1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LGR4Q9BXB1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LGR4Q9BXB1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LGR4Q9BXB1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LGR4Q9BXB1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LGR4Q9BXB1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LGR4Q9BXB1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LGR4Q9BXB1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LGR4Q9BXB1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LGR4Q9BXB1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LGR4Q9BXB1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LGR4Q9BXB1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LGR4Q9BXB1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LGR4Q9BXB1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LGR4Q9BXB1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LGR4Q9BXB1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LGR4Q9BXB1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LGR4Q9BXB1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LGR4Q9BXB1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LGR4Q9BXB1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LGR4Q9BXB1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LGR4Q9BXB1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LGR4Q9BXB1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LGR4Q9BXB1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LGR4Q9BXB1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LGR4Q9BXB1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LGR4Q9BXB1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LGR4Q9BXB1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LGR4Q9BXB1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LGR4Q9BXB1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LGR4Q9BXB1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LGR4Q9BXB1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LGR4Q9BXB1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LGR4Q9BXB1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LGR4Q9BXB1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LGR4Q9BXB1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LGR4Q9BXB1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LGR4Q9BXB1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LGR4Q9BXB1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LGR4Q9BXB1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LGR4Q9BXB1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LGR4Q9BXB1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LGR4Q9BXB1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LGR4Q9BXB1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LGR4Q9BXB1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
LGR4Q9BXB1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LGR4Q9BXB1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LGR4Q9BXB1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LGR4Q9BXB1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LGR4Q9BXB1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LGR4Q9BXB1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LGR4Q9BXB1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LGR4Q9BXB1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LGR4Q9BXB1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LGR4Q9BXB1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LGR4Q9BXB1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LGR4Q9BXB1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LGR4Q9BXB1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms