Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWQ6

YIPF2, Protein YIPF2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF2Q9BWQ6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YIPF2Q9BWQ6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YIPF2Q9BWQ6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YIPF2Q9BWQ6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YIPF2Q9BWQ6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YIPF2Q9BWQ6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YIPF2Q9BWQ6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YIPF2Q9BWQ6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YIPF2Q9BWQ6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YIPF2Q9BWQ6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
YIPF2Q9BWQ6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
YIPF2Q9BWQ6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
YIPF2Q9BWQ6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
YIPF2Q9BWQ6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
YIPF2Q9BWQ6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
YIPF2Q9BWQ6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
YIPF2Q9BWQ6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
YIPF2Q9BWQ6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
YIPF2Q9BWQ6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
YIPF2Q9BWQ6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
YIPF2Q9BWQ6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
YIPF2Q9BWQ6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
YIPF2Q9BWQ6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YIPF2Q9BWQ6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YIPF2Q9BWQ6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
YIPF2Q9BWQ6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YIPF2Q9BWQ6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YIPF2Q9BWQ6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
YIPF2Q9BWQ6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YIPF2Q9BWQ6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YIPF2Q9BWQ6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YIPF2Q9BWQ6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YIPF2Q9BWQ6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YIPF2Q9BWQ6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YIPF2Q9BWQ6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YIPF2Q9BWQ6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YIPF2Q9BWQ6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YIPF2Q9BWQ6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YIPF2Q9BWQ6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
YIPF2Q9BWQ6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YIPF2Q9BWQ6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YIPF2Q9BWQ6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YIPF2Q9BWQ6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YIPF2Q9BWQ6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YIPF2Q9BWQ6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YIPF2Q9BWQ6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YIPF2Q9BWQ6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YIPF2Q9BWQ6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
YIPF2Q9BWQ6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YIPF2Q9BWQ6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
YIPF2Q9BWQ6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YIPF2Q9BWQ6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
YIPF2Q9BWQ6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
YIPF2Q9BWQ6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
YIPF2Q9BWQ6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
YIPF2Q9BWQ6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
YIPF2Q9BWQ6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
YIPF2Q9BWQ6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
YIPF2Q9BWQ6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
YIPF2Q9BWQ6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YIPF2Q9BWQ6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YIPF2Q9BWQ6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YIPF2Q9BWQ6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YIPF2Q9BWQ6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
YIPF2Q9BWQ6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YIPF2Q9BWQ6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
YIPF2Q9BWQ6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YIPF2Q9BWQ6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YIPF2Q9BWQ6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YIPF2Q9BWQ6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
YIPF2Q9BWQ6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
YIPF2Q9BWQ6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
YIPF2Q9BWQ6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YIPF2Q9BWQ6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YIPF2Q9BWQ6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YIPF2Q9BWQ6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YIPF2Q9BWQ6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YIPF2Q9BWQ6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YIPF2Q9BWQ6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YIPF2Q9BWQ6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YIPF2Q9BWQ6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YIPF2Q9BWQ6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YIPF2Q9BWQ6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YIPF2Q9BWQ6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
YIPF2Q9BWQ6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
YIPF2Q9BWQ6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
YIPF2Q9BWQ6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
YIPF2Q9BWQ6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
YIPF2Q9BWQ6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
YIPF2Q9BWQ6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YIPF2Q9BWQ6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YIPF2Q9BWQ6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YIPF2Q9BWQ6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YIPF2Q9BWQ6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YIPF2Q9BWQ6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
YIPF2Q9BWQ6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
YIPF2Q9BWQ6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
YIPF2Q9BWQ6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
YIPF2Q9BWQ6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
YIPF2Q9BWQ6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms