Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
REPIN1Q9BWE0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
REPIN1Q9BWE0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
REPIN1Q9BWE0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
REPIN1Q9BWE0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
REPIN1Q9BWE0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
REPIN1Q9BWE0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
REPIN1Q9BWE0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
REPIN1Q9BWE0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
REPIN1Q9BWE0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
REPIN1Q9BWE0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
REPIN1Q9BWE0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
REPIN1Q9BWE0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
REPIN1Q9BWE0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
REPIN1Q9BWE0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
REPIN1Q9BWE0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
REPIN1Q9BWE0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
REPIN1Q9BWE0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
REPIN1Q9BWE0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
REPIN1Q9BWE0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
REPIN1Q9BWE0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
REPIN1Q9BWE0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REPIN1Q9BWE0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
REPIN1Q9BWE0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
REPIN1Q9BWE0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
REPIN1Q9BWE0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
REPIN1Q9BWE0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
REPIN1Q9BWE0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
REPIN1Q9BWE0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REPIN1Q9BWE0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REPIN1Q9BWE0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
REPIN1Q9BWE0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
REPIN1Q9BWE0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REPIN1Q9BWE0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REPIN1Q9BWE0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
REPIN1Q9BWE0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
REPIN1Q9BWE0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
REPIN1Q9BWE0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
REPIN1Q9BWE0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
REPIN1Q9BWE0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
REPIN1Q9BWE0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
REPIN1Q9BWE0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
REPIN1Q9BWE0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
REPIN1Q9BWE0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
REPIN1Q9BWE0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
REPIN1Q9BWE0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
REPIN1Q9BWE0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
REPIN1Q9BWE0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
REPIN1Q9BWE0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
REPIN1Q9BWE0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
REPIN1Q9BWE0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
REPIN1Q9BWE0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
REPIN1Q9BWE0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
REPIN1Q9BWE0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
REPIN1Q9BWE0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
REPIN1Q9BWE0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
REPIN1Q9BWE0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
REPIN1Q9BWE0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
REPIN1Q9BWE0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
REPIN1Q9BWE0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
REPIN1Q9BWE0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
REPIN1Q9BWE0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
REPIN1Q9BWE0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
REPIN1Q9BWE0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
REPIN1Q9BWE0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
REPIN1Q9BWE0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
REPIN1Q9BWE0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
REPIN1Q9BWE0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
REPIN1Q9BWE0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
REPIN1Q9BWE0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
REPIN1Q9BWE0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
REPIN1Q9BWE0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
REPIN1Q9BWE0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
REPIN1Q9BWE0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
REPIN1Q9BWE0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
REPIN1Q9BWE0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
REPIN1Q9BWE0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
REPIN1Q9BWE0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
REPIN1Q9BWE0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
REPIN1Q9BWE0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
REPIN1Q9BWE0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
REPIN1Q9BWE0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
REPIN1Q9BWE0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
REPIN1Q9BWE0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
REPIN1Q9BWE0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
REPIN1Q9BWE0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
REPIN1Q9BWE0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
REPIN1Q9BWE0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
REPIN1Q9BWE0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
REPIN1Q9BWE0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
REPIN1Q9BWE0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
REPIN1Q9BWE0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
REPIN1Q9BWE0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
REPIN1Q9BWE0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
REPIN1Q9BWE0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
REPIN1Q9BWE0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
REPIN1Q9BWE0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
REPIN1Q9BWE0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
REPIN1Q9BWE0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
REPIN1Q9BWE0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms