Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP58Q9BVL2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP58Q9BVL2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP58Q9BVL2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP58Q9BVL2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP58Q9BVL2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP58Q9BVL2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP58Q9BVL2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP58Q9BVL2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP58Q9BVL2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP58Q9BVL2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP58Q9BVL2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUP58Q9BVL2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUP58Q9BVL2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP58Q9BVL2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP58Q9BVL2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP58Q9BVL2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP58Q9BVL2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP58Q9BVL2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP58Q9BVL2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP58Q9BVL2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP58Q9BVL2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP58Q9BVL2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP58Q9BVL2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP58Q9BVL2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP58Q9BVL2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP58Q9BVL2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP58Q9BVL2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP58Q9BVL2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP58Q9BVL2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP58Q9BVL2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP58Q9BVL2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP58Q9BVL2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP58Q9BVL2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP58Q9BVL2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP58Q9BVL2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP58Q9BVL2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP58Q9BVL2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP58Q9BVL2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP58Q9BVL2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP58Q9BVL2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP58Q9BVL2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP58Q9BVL2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP58Q9BVL2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP58Q9BVL2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP58Q9BVL2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP58Q9BVL2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP58Q9BVL2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP58Q9BVL2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP58Q9BVL2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP58Q9BVL2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP58Q9BVL2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP58Q9BVL2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP58Q9BVL2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP58Q9BVL2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP58Q9BVL2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP58Q9BVL2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP58Q9BVL2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP58Q9BVL2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP58Q9BVL2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP58Q9BVL2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NUP58Q9BVL2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP58Q9BVL2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP58Q9BVL2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP58Q9BVL2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP58Q9BVL2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP58Q9BVL2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP58Q9BVL2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP58Q9BVL2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP58Q9BVL2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP58Q9BVL2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP58Q9BVL2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP58Q9BVL2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP58Q9BVL2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP58Q9BVL2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP58Q9BVL2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP58Q9BVL2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP58Q9BVL2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP58Q9BVL2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP58Q9BVL2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP58Q9BVL2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP58Q9BVL2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP58Q9BVL2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP58Q9BVL2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUP58Q9BVL2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUP58Q9BVL2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUP58Q9BVL2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUP58Q9BVL2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP58Q9BVL2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP58Q9BVL2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP58Q9BVL2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP58Q9BVL2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP58Q9BVL2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP58Q9BVL2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP58Q9BVL2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP58Q9BVL2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP58Q9BVL2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP58Q9BVL2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP58Q9BVL2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP58Q9BVL2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms