Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBB6Q9BUF5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBB6Q9BUF5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBB6Q9BUF5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBB6Q9BUF5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBB6Q9BUF5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBB6Q9BUF5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBB6Q9BUF5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBB6Q9BUF5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBB6Q9BUF5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBB6Q9BUF5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBB6Q9BUF5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBB6Q9BUF5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBB6Q9BUF5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TUBB6Q9BUF5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBB6Q9BUF5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBB6Q9BUF5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBB6Q9BUF5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBB6Q9BUF5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBB6Q9BUF5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBB6Q9BUF5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBB6Q9BUF5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBB6Q9BUF5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBB6Q9BUF5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBB6Q9BUF5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBB6Q9BUF5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBB6Q9BUF5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBB6Q9BUF5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBB6Q9BUF5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB6Q9BUF5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB6Q9BUF5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB6Q9BUF5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB6Q9BUF5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB6Q9BUF5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB6Q9BUF5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB6Q9BUF5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB6Q9BUF5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBB6Q9BUF5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBB6Q9BUF5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBB6Q9BUF5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBB6Q9BUF5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TUBB6Q9BUF5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TUBB6Q9BUF5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TUBB6Q9BUF5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TUBB6Q9BUF5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBB6Q9BUF5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBB6Q9BUF5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBB6Q9BUF5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBB6Q9BUF5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBB6Q9BUF5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBB6Q9BUF5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBB6Q9BUF5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBB6Q9BUF5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBB6Q9BUF5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBB6Q9BUF5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBB6Q9BUF5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBB6Q9BUF5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBB6Q9BUF5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBB6Q9BUF5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBB6Q9BUF5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBB6Q9BUF5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBB6Q9BUF5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBB6Q9BUF5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBB6Q9BUF5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBB6Q9BUF5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBB6Q9BUF5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBB6Q9BUF5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBB6Q9BUF5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBB6Q9BUF5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBB6Q9BUF5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBB6Q9BUF5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBB6Q9BUF5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBB6Q9BUF5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBB6Q9BUF5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBB6Q9BUF5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBB6Q9BUF5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB6Q9BUF5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB6Q9BUF5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB6Q9BUF5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB6Q9BUF5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB6Q9BUF5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB6Q9BUF5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB6Q9BUF5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB6Q9BUF5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB6Q9BUF5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB6Q9BUF5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB6Q9BUF5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBB6Q9BUF5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBB6Q9BUF5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBB6Q9BUF5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBB6Q9BUF5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBB6Q9BUF5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB6Q9BUF5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB6Q9BUF5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB6Q9BUF5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB6Q9BUF5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB6Q9BUF5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB6Q9BUF5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB6Q9BUF5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB6Q9BUF5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms