Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQT9

CLSTN3, Calsyntenin-3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3Q9BQT9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLSTN3Q9BQT9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLSTN3Q9BQT9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLSTN3Q9BQT9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLSTN3Q9BQT9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CLSTN3Q9BQT9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLSTN3Q9BQT9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLSTN3Q9BQT9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLSTN3Q9BQT9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLSTN3Q9BQT9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLSTN3Q9BQT9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLSTN3Q9BQT9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLSTN3Q9BQT9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLSTN3Q9BQT9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLSTN3Q9BQT9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLSTN3Q9BQT9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLSTN3Q9BQT9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CLSTN3Q9BQT9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLSTN3Q9BQT9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLSTN3Q9BQT9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLSTN3Q9BQT9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLSTN3Q9BQT9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLSTN3Q9BQT9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLSTN3Q9BQT9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CLSTN3Q9BQT9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CLSTN3Q9BQT9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLSTN3Q9BQT9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLSTN3Q9BQT9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLSTN3Q9BQT9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLSTN3Q9BQT9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLSTN3Q9BQT9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLSTN3Q9BQT9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLSTN3Q9BQT9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLSTN3Q9BQT9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLSTN3Q9BQT9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLSTN3Q9BQT9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLSTN3Q9BQT9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLSTN3Q9BQT9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLSTN3Q9BQT9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLSTN3Q9BQT9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLSTN3Q9BQT9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CLSTN3Q9BQT9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CLSTN3Q9BQT9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLSTN3Q9BQT9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CLSTN3Q9BQT9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLSTN3Q9BQT9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLSTN3Q9BQT9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLSTN3Q9BQT9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLSTN3Q9BQT9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLSTN3Q9BQT9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLSTN3Q9BQT9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLSTN3Q9BQT9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLSTN3Q9BQT9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLSTN3Q9BQT9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLSTN3Q9BQT9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLSTN3Q9BQT9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLSTN3Q9BQT9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLSTN3Q9BQT9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLSTN3Q9BQT9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLSTN3Q9BQT9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLSTN3Q9BQT9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLSTN3Q9BQT9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLSTN3Q9BQT9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLSTN3Q9BQT9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLSTN3Q9BQT9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLSTN3Q9BQT9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLSTN3Q9BQT9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLSTN3Q9BQT9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CLSTN3Q9BQT9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLSTN3Q9BQT9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.6 ms