Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
FYCO1Q9BQS8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC39.81■■■■□ 3.96
FYCO1Q9BQS8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
FYCO1Q9BQS8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC39.8■■■■□ 3.96
FYCO1Q9BQS8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC39.79■■■■□ 3.96
FYCO1Q9BQS8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
FYCO1Q9BQS8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC39.77■■■■□ 3.96
FYCO1Q9BQS8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
FYCO1Q9BQS8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
FYCO1Q9BQS8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
FYCO1Q9BQS8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
FYCO1Q9BQS8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
FYCO1Q9BQS8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
FYCO1Q9BQS8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
FYCO1Q9BQS8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
FYCO1Q9BQS8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
FYCO1Q9BQS8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
FYCO1Q9BQS8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
FYCO1Q9BQS8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
FYCO1Q9BQS8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC39.73■■■■□ 3.95
FYCO1Q9BQS8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
FYCO1Q9BQS8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
FYCO1Q9BQS8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
FYCO1Q9BQS8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
FYCO1Q9BQS8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
FYCO1Q9BQS8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
FYCO1Q9BQS8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
FYCO1Q9BQS8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
FYCO1Q9BQS8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC39.69■■■■□ 3.94
FYCO1Q9BQS8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
FYCO1Q9BQS8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
FYCO1Q9BQS8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC39.68■■■■□ 3.94
FYCO1Q9BQS8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC39.68■■■■□ 3.94
FYCO1Q9BQS8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
FYCO1Q9BQS8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
FYCO1Q9BQS8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
FYCO1Q9BQS8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
FYCO1Q9BQS8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
FYCO1Q9BQS8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
FYCO1Q9BQS8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
FYCO1Q9BQS8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
FYCO1Q9BQS8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
FYCO1Q9BQS8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
FYCO1Q9BQS8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
FYCO1Q9BQS8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
FYCO1Q9BQS8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
FYCO1Q9BQS8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
FYCO1Q9BQS8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.94
FYCO1Q9BQS8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
FYCO1Q9BQS8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
FYCO1Q9BQS8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
FYCO1Q9BQS8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
FYCO1Q9BQS8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
FYCO1Q9BQS8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
FYCO1Q9BQS8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
FYCO1Q9BQS8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC39.61■■■■□ 3.93
FYCO1Q9BQS8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
FYCO1Q9BQS8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
FYCO1Q9BQS8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
FYCO1Q9BQS8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
FYCO1Q9BQS8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
FYCO1Q9BQS8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
FYCO1Q9BQS8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
FYCO1Q9BQS8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
FYCO1Q9BQS8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.92
FYCO1Q9BQS8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
FYCO1Q9BQS8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
FYCO1Q9BQS8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
FYCO1Q9BQS8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
FYCO1Q9BQS8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
FYCO1Q9BQS8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC39.53■■■■□ 3.92
FYCO1Q9BQS8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
FYCO1Q9BQS8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
FYCO1Q9BQS8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
FYCO1Q9BQS8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
FYCO1Q9BQS8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
FYCO1Q9BQS8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
FYCO1Q9BQS8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
FYCO1Q9BQS8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
FYCO1Q9BQS8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
FYCO1Q9BQS8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
FYCO1Q9BQS8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
FYCO1Q9BQS8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
FYCO1Q9BQS8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
FYCO1Q9BQS8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
FYCO1Q9BQS8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
FYCO1Q9BQS8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
FYCO1Q9BQS8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
FYCO1Q9BQS8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
FYCO1Q9BQS8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
FYCO1Q9BQS8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
FYCO1Q9BQS8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC39.46■■■■□ 3.91
FYCO1Q9BQS8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
FYCO1Q9BQS8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
FYCO1Q9BQS8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
FYCO1Q9BQS8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.91
FYCO1Q9BQS8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
FYCO1Q9BQS8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
FYCO1Q9BQS8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
FYCO1Q9BQS8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms