Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DUSP9Q99956 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
DUSP9Q99956 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DUSP9Q99956 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
DUSP9Q99956 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DUSP9Q99956 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DUSP9Q99956 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DUSP9Q99956 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DUSP9Q99956 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DUSP9Q99956 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUSP9Q99956 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUSP9Q99956 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUSP9Q99956 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUSP9Q99956 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DUSP9Q99956 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DUSP9Q99956 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DUSP9Q99956 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DUSP9Q99956 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DUSP9Q99956 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
DUSP9Q99956 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
DUSP9Q99956 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DUSP9Q99956 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DUSP9Q99956 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DUSP9Q99956 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DUSP9Q99956 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DUSP9Q99956 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DUSP9Q99956 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DUSP9Q99956 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DUSP9Q99956 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DUSP9Q99956 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DUSP9Q99956 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DUSP9Q99956 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DUSP9Q99956 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DUSP9Q99956 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DUSP9Q99956 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DUSP9Q99956 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DUSP9Q99956 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DUSP9Q99956 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DUSP9Q99956 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DUSP9Q99956 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DUSP9Q99956 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DUSP9Q99956 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DUSP9Q99956 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DUSP9Q99956 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DUSP9Q99956 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DUSP9Q99956 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DUSP9Q99956 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DUSP9Q99956 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DUSP9Q99956 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DUSP9Q99956 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DUSP9Q99956 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DUSP9Q99956 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DUSP9Q99956 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DUSP9Q99956 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DUSP9Q99956 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DUSP9Q99956 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DUSP9Q99956 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DUSP9Q99956 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DUSP9Q99956 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DUSP9Q99956 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DUSP9Q99956 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DUSP9Q99956 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DUSP9Q99956 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DUSP9Q99956 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DUSP9Q99956 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DUSP9Q99956 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DUSP9Q99956 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DUSP9Q99956 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DUSP9Q99956 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
DUSP9Q99956 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DUSP9Q99956 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DUSP9Q99956 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
DUSP9Q99956 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DUSP9Q99956 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
DUSP9Q99956 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DUSP9Q99956 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DUSP9Q99956 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DUSP9Q99956 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
DUSP9Q99956 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
DUSP9Q99956 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
DUSP9Q99956 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DUSP9Q99956 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
DUSP9Q99956 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
DUSP9Q99956 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
DUSP9Q99956 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DUSP9Q99956 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DUSP9Q99956 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
DUSP9Q99956 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
DUSP9Q99956 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DUSP9Q99956 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DUSP9Q99956 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DUSP9Q99956 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DUSP9Q99956 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DUSP9Q99956 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DUSP9Q99956 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DUSP9Q99956 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DUSP9Q99956 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.52■■■□□ 2
DUSP9Q99956 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
DUSP9Q99956 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
DUSP9Q99956 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms