Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NOTCH4Q99466 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NOTCH4Q99466 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NOTCH4Q99466 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NOTCH4Q99466 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOTCH4Q99466 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOTCH4Q99466 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOTCH4Q99466 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOTCH4Q99466 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOTCH4Q99466 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NOTCH4Q99466 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOTCH4Q99466 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOTCH4Q99466 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOTCH4Q99466 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOTCH4Q99466 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NOTCH4Q99466 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NOTCH4Q99466 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NOTCH4Q99466 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NOTCH4Q99466 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NOTCH4Q99466 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NOTCH4Q99466 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NOTCH4Q99466 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NOTCH4Q99466 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NOTCH4Q99466 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOTCH4Q99466 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOTCH4Q99466 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOTCH4Q99466 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NOTCH4Q99466 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NOTCH4Q99466 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NOTCH4Q99466 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NOTCH4Q99466 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NOTCH4Q99466 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NOTCH4Q99466 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NOTCH4Q99466 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NOTCH4Q99466 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NOTCH4Q99466 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NOTCH4Q99466 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NOTCH4Q99466 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NOTCH4Q99466 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NOTCH4Q99466 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NOTCH4Q99466 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NOTCH4Q99466 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOTCH4Q99466 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOTCH4Q99466 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOTCH4Q99466 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOTCH4Q99466 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOTCH4Q99466 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOTCH4Q99466 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NOTCH4Q99466 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NOTCH4Q99466 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NOTCH4Q99466 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NOTCH4Q99466 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NOTCH4Q99466 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NOTCH4Q99466 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NOTCH4Q99466 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NOTCH4Q99466 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NOTCH4Q99466 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NOTCH4Q99466 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NOTCH4Q99466 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NOTCH4Q99466 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NOTCH4Q99466 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NOTCH4Q99466 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NOTCH4Q99466 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NOTCH4Q99466 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NOTCH4Q99466 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NOTCH4Q99466 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NOTCH4Q99466 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NOTCH4Q99466 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NOTCH4Q99466 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NOTCH4Q99466 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NOTCH4Q99466 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NOTCH4Q99466 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NOTCH4Q99466 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NOTCH4Q99466 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NOTCH4Q99466 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NOTCH4Q99466 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NOTCH4Q99466 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NOTCH4Q99466 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOTCH4Q99466 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOTCH4Q99466 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOTCH4Q99466 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOTCH4Q99466 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOTCH4Q99466 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOTCH4Q99466 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOTCH4Q99466 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOTCH4Q99466 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOTCH4Q99466 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NOTCH4Q99466 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NOTCH4Q99466 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NOTCH4Q99466 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NOTCH4Q99466 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOTCH4Q99466 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOTCH4Q99466 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NOTCH4Q99466 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOTCH4Q99466 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOTCH4Q99466 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOTCH4Q99466 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOTCH4Q99466 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NOTCH4Q99466 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOTCH4Q99466 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms